49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2836 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  87.2 
 
 		 164 aa  294  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  87.26 
 
 		 162 aa  287  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  73.57 
 
 		 158 aa  229  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 153 aa  152  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  50.36 
 
 		 145 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  49.64 
 
 		 145 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  48.59 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  48.59 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  47.89 
 
 		 144 aa  147  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  48.59 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  44.16 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  47.68 
 
 		 153 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  48.15 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  48.41 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  43.15 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  37.69 
 
 		 140 aa  114  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  39.42 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  28.24 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  27.91 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  30.77 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  30.66 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  29.85 
 
 		 166 aa  50.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0568  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  27.13 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  27.13 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  24 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  31.82 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  24.31 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  33.33 
 
 		 318 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  27.63 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 136 aa  40.8  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>