197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1112 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 490 aa  976    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  47.98 
 
 		 493 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  44.79 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  44.99 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  44.79 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  46.34 
 
 		 489 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  45.81 
 
 		 487 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  43.15 
 
 		 464 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  45.81 
 
 		 487 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  43.94 
 
 		 487 aa  350  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  45.14 
 
 		 483 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  43.06 
 
 		 496 aa  335  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  37.58 
 
 		 484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  39.52 
 
 		 495 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  38.83 
 
 		 495 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  38.57 
 
 		 486 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  39.59 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 		 472 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  34.01 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 		 485 aa  155  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 482 aa  123  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  31.44 
 
 		 623 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 		 481 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  31.05 
 
 		 613 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  30.21 
 
 		 623 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  30.51 
 
 		 623 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.36 
 
 		 727 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  27.81 
 
 		 626 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.39 
 
 		 588 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  27.27 
 
 		 588 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 		 704 aa  90.5  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  27.47 
 
 		 587 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 		 623 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.5 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  22.94 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.71 
 
 		 611 aa  84.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  20.55 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 		 546 aa  80.1  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.66 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.24 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  23.66 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  25.36 
 
 		 619 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  22.66 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.28 
 
 		 640 aa  76.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.28 
 
 		 847 aa  76.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  23.4 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  23.55 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.74 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.01 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 		 632 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  24.18 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.74 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.01 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26.01 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 		 640 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  24.38 
 
 		 503 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.01 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.01 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  21.41 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  23.85 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  21.59 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  24.19 
 
 		 637 aa  70.5  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  20.4 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.14 
 
 		 622 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.47 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.76 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.47 
 
 		 858 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  25.56 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.19 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  25.78 
 
 		 647 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  27.02 
 
 		 658 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  20.89 
 
 		 486 aa  66.6  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0208  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.750314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  22.99 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  20 
 
 		 627 aa  64.3  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  24.12 
 
 		 920 aa  64.3  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  22.74 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  21.72 
 
 		 477 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  22.86 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  22.78 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  24.08 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  21.71 
 
 		 846 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>