224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0874 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  65.53 
 
 		 587 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  73.85 
 
 		 588 aa  784    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 588 aa  1113    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  62.31 
 
 		 585 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  31.02 
 
 		 623 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  30.89 
 
 		 623 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  31.92 
 
 		 623 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  34.53 
 
 		 727 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  30.98 
 
 		 619 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  30.65 
 
 		 622 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.62 
 
 		 611 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  36.15 
 
 		 626 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  33.85 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  29.58 
 
 		 618 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.63 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  31.82 
 
 		 613 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  24.8 
 
 		 588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  33.64 
 
 		 487 aa  134  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  34.25 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 484 aa  130  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  35.03 
 
 		 632 aa  125  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  35.22 
 
 		 632 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  35.03 
 
 		 632 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  27.29 
 
 		 566 aa  120  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 		 484 aa  117  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 		 496 aa  114  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  30.97 
 
 		 484 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 		 487 aa  110  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 		 698 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  31.88 
 
 		 485 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.38 
 
 		 623 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  30.91 
 
 		 486 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  31.07 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 		 490 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 		 623 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 		 481 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  21.68 
 
 		 637 aa  100  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 464 aa  99.8  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 		 476 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 		 477 aa  98.6  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 		 486 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.7 
 
 		 457 aa  95.1  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  27.92 
 
 		 493 aa  91.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 		 548 aa  90.9  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  22.4 
 
 		 617 aa  90.9  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 631 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 		 818 aa  90.1  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  24.26 
 
 		 644 aa  89.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 		 478 aa  88.6  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 		 472 aa  88.2  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 		 495 aa  87.8  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.93 
 
 		 458 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  26.71 
 
 		 457 aa  87  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 483 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.95 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  25.48 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.34 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  26.77 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  27.08 
 
 		 657 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  23.7 
 
 		 614 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 640 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 		 690 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 624 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 624 aa  82  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  28.71 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  27.17 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 		 637 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 		 682 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.94 
 
 		 642 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.26 
 
 		 858 aa  79.7  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  26.46 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.26 
 
 		 858 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 		 626 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 456 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.86 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  22.38 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  21.71 
 
 		 847 aa  78.2  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 		 485 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  25.54 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  25.54 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.54 
 
 		 554 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.1 
 
 		 920 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  24.07 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 		 680 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  23.88 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  20.47 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 487 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 		 683 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  19.94 
 
 		 627 aa  75.1  0.000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 		 697 aa  75.1  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 638 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  26.77 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>