More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4586 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  93.93 
 
 		 313 aa  570  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  89.39 
 
 		 312 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  81.82 
 
 		 313 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  79.22 
 
 		 312 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  80.84 
 
 		 312 aa  465  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  80.52 
 
 		 353 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  80.52 
 
 		 328 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  80.52 
 
 		 328 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  69.79 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  62.42 
 
 		 318 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  61.87 
 
 		 321 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  59.27 
 
 		 310 aa  340  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  55.88 
 
 		 316 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  56.62 
 
 		 315 aa  338  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  56.52 
 
 		 312 aa  334  9e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  54.66 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  55.63 
 
 		 315 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  55.23 
 
 		 316 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  54.61 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  56.77 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  57.28 
 
 		 316 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  53.92 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  53.92 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  54.82 
 
 		 309 aa  305  7e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  57.09 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  58.3 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  59.85 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  57.6 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  55.25 
 
 		 305 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  59.85 
 
 		 317 aa  299  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  55.86 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  57.88 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  54.9 
 
 		 315 aa  293  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  53.54 
 
 		 311 aa  292  6e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  55.36 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  51.68 
 
 		 304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  45.61 
 
 		 295 aa  276  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  49.64 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  53.33 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 295 aa  261  2e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  47.72 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  45.2 
 
 		 299 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  47.12 
 
 		 534 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 535 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 		 303 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 301 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  45.3 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  47.33 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  45.64 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  44.64 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  46.83 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 		 300 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  47.64 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 622 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.63 
 
 		 443 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  44.84 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  44.6 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  45.55 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  43.29 
 
 		 324 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  44.21 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.88 
 
 		 317 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  41.08 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.26 
 
 		 328 aa  201  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  44.26 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  43.92 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  44.6 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>