195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3400 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  84.67 
 
 		 141 aa  233  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  67.97 
 
 		 149 aa  204  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  62.59 
 
 		 156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1686  manganese transport regulator MntR  61.39 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  51.32 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  51.32 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  55.65 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  55.91 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  52.67 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  52.67 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  51.47 
 
 		 170 aa  130  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  54.4 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.28 
 
 		 153 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  49.34 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  52.24 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  51.09 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  50.77 
 
 		 152 aa  126  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  46.26 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  47.97 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  45.58 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  47.02 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  44.9 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  44.9 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  44.9 
 
 		 157 aa  121  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  44.9 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  44.9 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  43.23 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  44.16 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  46.92 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32.7 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  36.84 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  33.88 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.61 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  29.51 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  39.13 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  41.53 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.07 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  34.82 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.98 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.94 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 		 168 aa  70.9  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  34.82 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  35.58 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  31.67 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  37.61 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  30.51 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  34.62 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  38.26 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  31.9 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.52 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  34.78 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  35.96 
 
 		 270 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.28 
 
 		 227 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1495  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.19 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0198257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  33.93 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.91 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.03 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  33.96 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  38.04 
 
 		 250 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.21 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  26.79 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  30.36 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  28.83 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  38.33 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  30.53 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0318  iron dependent repressor  36.84 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.78 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  35.35 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.96 
 
 		 234 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.82 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.7 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.85 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.35 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  29.82 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  29.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>