90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2372 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.862262  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3082  hypothetical protein  97.5 
 
 		 80 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.350654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3578  hypothetical protein  95 
 
 		 80 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3347  hypothetical protein  93.75 
 
 		 80 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1730  hypothetical protein  87.18 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.291518  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2162  hypothetical protein  87.18 
 
 		 87 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4891  hypothetical protein  86.67 
 
 		 99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.752891  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6294  surface presentation of antigens (SPOA) protein  53.95 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  53.95 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0287673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4725  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.63 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.0181493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4210  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.63 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.584381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4580  surface presentation of antigens (SPOA) protein  52.63 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0619542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2775  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.58 
 
 		 78 aa  76.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.408446  normal  0.0989271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3806  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.58 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1744  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.490254  normal  0.469262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3160  hypothetical protein  44.87 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  37.66 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  36.36 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  36.36 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0114  putative flagellar motor switch protein FliN  37.5 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  36.99 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0540  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.14 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.232072  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0123  flagellar motor switch protein FliN, putative  36.25 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  32.39 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1473  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0646  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0558  flagellar motor switch FliN  32.39 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3170  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.76 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1121  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.5679 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1689  flagellar motor switch protein  29.41 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.812103  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3073  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154609  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3799  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4387  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  30.99 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0975  flagellar motor switch protein  29.41 
 
 		 105 aa  47  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  30.99 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  35.29 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  35.62 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  35.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  33.8 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4457  flagellar motor switch protein FliN  36.76 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  37.14 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4089  flagellar motor switch protein FliN  36.76 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  hitchhiker  0.00242044  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  38.89 
 
 		 401 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4570  flagellar motor switch protein FliN  42.03 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  37.68 
 
 		 360 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5056  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.423676  normal  0.789491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  34.67 
 
 		 393 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  30.56 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0171  flagellar motor switch protein  29.41 
 
 		 98 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323652  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  37.5 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  35.29 
 
 		 395 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  34.25 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0767  flagellar motor switch protein FliN  32.47 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  35.14 
 
 		 393 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0356  flagellar motor switch protein  27.94 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2181  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.475911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0717  flagellar motor switch protein  36 
 
 		 572 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.67 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0724  flagellar motor switch protein FliN  30.56 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0400  flagellar motor switch protein  27.94 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  32.39 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.68 
 
 		 398 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1755  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.84 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0375  flagellar motor switch protein  27.94 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1607  flagellar motor switch protein  27.94 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  31.58 
 
 		 110 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.43 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6060  flagellar motor switch protein FliN  35.29 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.378141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5123  flagellar motor switch protein FliN  33.82 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  36.62 
 
 		 375 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  28.99 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  28.99 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  28.99 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  30.43 
 
 		 411 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.21 
 
 		 370 aa  41.2  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  28.17 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  33.78 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  31.94 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  30.99 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  32.39 
 
 		 249 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>