265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1755 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1755  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
127 aa  254  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  45.95 
 
 
249 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2398  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.65 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0784  flagellar motor switch FliN  43.9 
 
 
124 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0020352  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0698  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.94 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.137334  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.81 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  45.16 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  44.92 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2035  surface presentation of antigens (SPOA) protein  47.56 
 
 
114 aa  80.1  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.853353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  54.32 
 
 
250 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  43.01 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  35.45 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1364  flagellar motor switch FliN  47.19 
 
 
97 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.000279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2589  flagellar motor switch protein FliN  47.19 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0772408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2493  flagellar motor switch protein FliN  47.19 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484808  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2908  flagellar motor switch protein FliN  43.96 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  35.45 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  35.45 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  35.45 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  38.68 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  35.45 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  35.45 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  42.7 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  40 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  43 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2213  flagellar motor switch protein FliN  43.82 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.728739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  43 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  43.3 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  43 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  46.67 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  50 
 
 
417 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1755  flagellar motor switch protein FliN  45.95 
 
 
109 aa  73.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  40.38 
 
 
370 aa  73.6  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1755  flagellar motor switch protein FliN  46.58 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3585  surface presentation of antigens (SPOA) protein  41.57 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.836136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  39.36 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  39.18 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  34.55 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  39.08 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  39.08 
 
 
136 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2733  flagellar motor switch protein FliN  40.91 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.34 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  39.62 
 
 
381 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 
157 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  52 
 
 
249 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2915  flagellar motor switch protein FliN  41.57 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.369228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1872  flagellar motor switch protein FliN  43.21 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267191  normal  0.473896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  39.58 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  39.8 
 
 
378 aa  71.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  46.67 
 
 
246 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  40.7 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  45.57 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  46.48 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  44.16 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  44.16 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  39.33 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  46.48 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  42.86 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  41.67 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0157  flagellar motor switch protein FliN  42.5 
 
 
154 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491458 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  44 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  42.55 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  38.1 
 
 
422 aa  70.5  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1510  flagellar motor switch protein  33.04 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2702  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  42.86 
 
 
401 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0537803  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  37.11 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  45.33 
 
 
163 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  45.33 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  45.33 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  45.71 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  36.54 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  42.31 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  37.61 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  43.04 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  41.41 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  45.71 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  43.59 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  46.05 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  44 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  39.78 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  40.23 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1548  flagellar motor switch protein FliN  37.78 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>