More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1545 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 415 aa  859    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  96.51 
 
 		 372 aa  725    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  62.81 
 
 		 405 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  54.78 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  52.86 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  54.29 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  54.94 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  50.28 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  50.98 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  50.55 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  50.69 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  51.25 
 
 		 368 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  49.3 
 
 		 347 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  50.28 
 
 		 369 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  51.43 
 
 		 369 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  50.7 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  50.42 
 
 		 353 aa  329  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  51.71 
 
 		 357 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  49.72 
 
 		 369 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  47.43 
 
 		 386 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  50 
 
 		 361 aa  322  5e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  46.26 
 
 		 361 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  49.3 
 
 		 376 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  50 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  45.38 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  51.01 
 
 		 356 aa  316  6e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  49.3 
 
 		 410 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  50.14 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  46.94 
 
 		 375 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  49.04 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  49.04 
 
 		 358 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  51.54 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  51.27 
 
 		 389 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 360 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.81 
 
 		 358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  60.08 
 
 		 257 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  63.04 
 
 		 257 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  45 
 
 		 355 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  59.27 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  59.27 
 
 		 257 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  59.27 
 
 		 257 aa  286  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  58.87 
 
 		 257 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  45.94 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  58.87 
 
 		 257 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.78 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.51 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  59.13 
 
 		 259 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.79 
 
 		 343 aa  256  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.18 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.06 
 
 		 342 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  42.82 
 
 		 346 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.08 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  49.61 
 
 		 343 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.03 
 
 		 352 aa  246  6e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 		 362 aa  246  6e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  40.81 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.9 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  58.26 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  58.26 
 
 		 256 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 341 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  57.83 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.45 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 377 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.21 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1766  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6329  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  41.49 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.7 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.03 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.74 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  40.11 
 
 		 360 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  39.89 
 
 		 379 aa  239  9e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.17 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  38.83 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  38.83 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.51 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 		 377 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  42.9 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  41.57 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.26 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.59 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>