92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1193 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  98.06 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  75 
 
 		 320 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5783  hypothetical protein  32.98 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.614473  hitchhiker  0.00280675 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0791  hypothetical protein  28.22 
 
 		 353 aa  99.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0217127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0547  hypothetical protein  31.23 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.059421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.221169  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0335  hypothetical protein  26.96 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  31.44 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  25.44 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.9 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.56 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.475226 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.09 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  23.15 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  26.07 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0667  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.47 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  30.36 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  33.93 
 
 		 277 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0416  hypothetical protein  24.77 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.848373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  25.52 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.34 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  25.18 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.94 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  25.18 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.71 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  21.51 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  23.28 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  24.14 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  23.28 
 
 		 303 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.71 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23.38 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3517  hypothetical protein  26.64 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2065  hypothetical protein  24.52 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.811654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  21.76 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  23.38 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  23.38 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.38 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.28 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  27.54 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  29.89 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  22.65 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  22.65 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  21.18 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  22.71 
 
 		 315 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  23.81 
 
 		 322 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  25.31 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  22.65 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  22.65 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2640  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  24.08 
 
 		 298 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  21.4 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  21.53 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  19.06 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  27.87 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  21 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.03 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  25.7 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.73 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.12 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3724  hypothetical protein  27.23 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  21.38 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  25.56 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  25.7 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0614  hypothetical protein  23.33 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.01 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  21.05 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  27.87 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.86 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  21.05 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  21.91 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  27.87 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  21.05 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  21.61 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.27 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1128  hypothetical protein  29.3 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  24.59 
 
 		 325 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.99 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00120  permease  22.96 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.25 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  25.21 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>