More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2060 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  77.2 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  75.65 
 
 		 193 aa  308  2.9999999999999997e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  45.54 
 
 		 684 aa  95.1  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  43.41 
 
 		 789 aa  93.2  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  41.53 
 
 		 252 aa  90.1  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.03 
 
 		 1402 aa  89.4  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  34.62 
 
 		 490 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.69 
 
 		 961 aa  89  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  39.45 
 
 		 256 aa  89  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.97 
 
 		 490 aa  88.2  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 		 528 aa  85.1  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  31.87 
 
 		 241 aa  84.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1493 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 1012 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  34.19 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.11 
 
 		 318 aa  81.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  39.39 
 
 		 971 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.39 
 
 		 971 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.76 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.1 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.39 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  34.75 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 1032 aa  78.6  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  33.99 
 
 		 416 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  31.77 
 
 		 489 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 831 aa  78.2  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.96 
 
 		 346 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2413 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  42.86 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  38.39 
 
 		 425 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1877 aa  75.9  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  35.29 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.39 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.38 
 
 		 393 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1002 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1037 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.79 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  41.11 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.53 
 
 		 976 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  33.9 
 
 		 448 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  38.02 
 
 		 838 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.61 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.11 
 
 		 325 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  41.11 
 
 		 325 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  31.97 
 
 		 376 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.72 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  41.11 
 
 		 285 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  40.22 
 
 		 942 aa  71.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  36.44 
 
 		 338 aa  71.2  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  41.11 
 
 		 325 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.21 
 
 		 329 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.12 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  33.88 
 
 		 1059 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  39.29 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  43.18 
 
 		 117 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  39.5 
 
 		 1141 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.78 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.24 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  35.4 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  42.22 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  43.53 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  31.85 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.21 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.81 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.97 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.86 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  39.18 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  35.65 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.47 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  36.54 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  30.6 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  36.09 
 
 		 763 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1424  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 357 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240665  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 1226 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  40.23 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  33.86 
 
 		 509 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  39.13 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.13 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  38.27 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  30.2 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.27 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.86 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.88 
 
 		 731 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 1261 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.27 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  37.11 
 
 		 399 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.21 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  34.13 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3183  Sel1 repeat-containing protein  34.68 
 
 		 337 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440754  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  34.13 
 
 		 509 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  33.33 
 
 		 1086 aa  65.1  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  38.24 
 
 		 817 aa  65.1  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>