More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4550 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  92.05 
 
 		 365 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  100 
 
 		 365 aa  739    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  92.05 
 
 		 365 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  92.88 
 
 		 365 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  79.43 
 
 		 366 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  76 
 
 		 367 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  76.29 
 
 		 367 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  73.13 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  74.03 
 
 		 363 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  70.86 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  70.57 
 
 		 404 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  50.56 
 
 		 375 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  46.46 
 
 		 372 aa  306  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  46.35 
 
 		 376 aa  298  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  45.94 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  42.94 
 
 		 368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  40.88 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  40.88 
 
 		 363 aa  260  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  40.62 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  37.91 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.7 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  35.47 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  29.51 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  29.51 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  28.37 
 
 		 369 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29.23 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  29.8 
 
 		 369 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.94 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  28.08 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  29.14 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.14 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  28.57 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.98 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  34.84 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  35.5 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  35.2 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  31.45 
 
 		 368 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  34.93 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.85 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  32.95 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31.46 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.05 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.27 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.64 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.67 
 
 		 440 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  33.8 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.07 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  33.69 
 
 		 384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  27.27 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  31.54 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  26.74 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  26.74 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 441 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  26.47 
 
 		 371 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  26.88 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  26.88 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  26.74 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  31.77 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.2 
 
 		 371 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 374 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.2 
 
 		 371 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  32.77 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.89 
 
 		 371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  31.3 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  26.1 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.23 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2389  D-amino-acid dehydrogenase  28.01 
 
 		 439 aa  119  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.82 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.48 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.11 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  25.45 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  28.74 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1546  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 416 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.88 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  30.86 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0673  D-amino-acid dehydrogenase  28.37 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180164  hitchhiker  0.00553067 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  31.84 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  32.69 
 
 		 652 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47980  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.3 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  29.89 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>