More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2220 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  92.67 
 
 		 463 aa  854    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  80.89 
 
 		 463 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  93.78 
 
 		 463 aa  863    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  82.14 
 
 		 465 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  93.11 
 
 		 463 aa  859    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  100 
 
 		 463 aa  941    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  80.89 
 
 		 465 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  65.87 
 
 		 491 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  65.44 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  65.66 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 		 462 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  65.66 
 
 		 521 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  68.58 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  63.85 
 
 		 462 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  64.89 
 
 		 462 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  64.29 
 
 		 463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  55.12 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  53.81 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  46.55 
 
 		 466 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 486 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  41.8 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0634  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 476 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  41.13 
 
 		 469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 454 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  37.78 
 
 		 496 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  32.97 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  34.02 
 
 		 460 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 460 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 472 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  33.41 
 
 		 466 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 459 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  33.49 
 
 		 473 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 473 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 462 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 476 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 466 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 465 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  33.19 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  34.14 
 
 		 480 aa  174  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 462 aa  173  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 		 474 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  31.86 
 
 		 439 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.88 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.88 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.88 
 
 		 426 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.88 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.88 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  31.63 
 
 		 439 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.88 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.61 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  34.08 
 
 		 475 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  33.48 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 464 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 433 aa  162  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.21 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 443 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  35.43 
 
 		 429 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 		 456 aa  159  7e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 472 aa  158  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 427 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  28.75 
 
 		 427 aa  154  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.51 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  32.33 
 
 		 468 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 483 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  30.48 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  30.07 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 		 427 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>