More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4112 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1374  FAD dependent oxidoreductase  72.67 
 
 		 439 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4112  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 439 aa  907    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09750  putative oxidoreductase  76.54 
 
 		 439 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2113  putative oxidoreductase protein  73.32 
 
 		 387 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0578145  normal  0.36209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5757  FAD dependent oxidoreductase  40.6 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001295  glycine/D-amino acid oxidase  41.97 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6865  FAD dependent oxidoreductase  40.41 
 
 		 443 aa  349  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2818  FAD dependent oxidoreductase  40.36 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5370  oxidoreductase-related protein  41.31 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.195 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4836  FAD dependent oxidoreductase  36.24 
 
 		 448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4482  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5280  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 448 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.607328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4199  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 		 437 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2297  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3065  hypothetical protein  35.07 
 
 		 448 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0139193  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4774  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 448 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.952242  normal  0.115123 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4005  oxidoreductase, NAD-binding site  37.59 
 
 		 446 aa  269  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0756508  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7256  oxidoreductase  32.89 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4822  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 		 448 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537727  normal  0.272998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1106  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 439 aa  262  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4751  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.563662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2476  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.326489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  28.22 
 
 		 473 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 		 480 aa  142  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  29.56 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.75 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 496 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  29.95 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 494 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  27.85 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  29.84 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  29.35 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.62 
 
 		 438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  27.45 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 475 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  26.95 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.6 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 470 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  27.88 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  27.01 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  27.01 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  27.11 
 
 		 443 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 436 aa  123  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  28.54 
 
 		 428 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  26.02 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 494 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 494 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 427 aa  123  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 463 aa  123  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 464 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  26.45 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  27.53 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  26.45 
 
 		 427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>