More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3669 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 417 aa  809    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  68.43 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  61.81 
 
 		 422 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  61.64 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  59.8 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  55.69 
 
 		 423 aa  418  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  56.22 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  61.48 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  59.55 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  59.8 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  59.85 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  56.82 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  55.61 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  57.39 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  56.33 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  55.42 
 
 		 417 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  55.42 
 
 		 417 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  59.3 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  58.23 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  54.93 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  56.5 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  55.92 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  34.8 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  31.09 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  31.96 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  34.8 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  32.67 
 
 		 424 aa  186  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  37.66 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  35.45 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  32.42 
 
 		 415 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  31.98 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  31.71 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  32.2 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  32.64 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  32.64 
 
 		 411 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  25.06 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  25.36 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  25.99 
 
 		 429 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  31.36 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  32.64 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  30.32 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  30.83 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  27.86 
 
 		 430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  24.4 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  33.93 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  30.45 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  30.62 
 
 		 435 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  31.76 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  30.16 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  25.69 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  25.69 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  30.35 
 
 		 427 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  28.12 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  29.79 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  30.77 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  30.16 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  25.64 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  28.61 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  30.95 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  32.16 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  27.82 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  29.78 
 
 		 426 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  26.75 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  29.7 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.99 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  29.78 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  28.22 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.51 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  28.69 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  29.28 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  29.22 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  29.21 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  29.16 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  29.78 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  26.68 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  29.22 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  29.5 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.85 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  29.5 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  28.99 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  29.23 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  30.3 
 
 		 427 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0889  Arsenical pump membrane protein  29.17 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  28.42 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  29.11 
 
 		 431 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  29.78 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  29.21 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  27.76 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  30.83 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  31.47 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  26.3 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.23 
 
 		 438 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>