More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3185 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3185  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1667  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.460826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0615  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494418 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1517  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2070  putative alpha/beta hydrolase fold precursor  28.98 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  28.26 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.14 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.06 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  30.57 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  21.79 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  21.79 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  21.71 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.79 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  21.71 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.37 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  25 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.387123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4699  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3663  alpha/beta hydrolase fold  35.17 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.378837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  21.43 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 405 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  22.71 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  21.97 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  21.07 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  20.94 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  22.56 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1443  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.79 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.53 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  32.88 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5227  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.968895  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  21.3 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  23.38 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  24.28 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  31.3 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  34.48 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  24.37 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6043  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  23.72 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 286 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  21.11 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.19 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 		 260 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  24.76 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 		 322 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  25.44 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  21.74 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 340 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  29.66 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>