More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3241 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3241  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  81 
 
 
221 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  81 
 
 
221 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  83.26 
 
 
221 aa  367  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  81.9 
 
 
221 aa  359  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  79.64 
 
 
221 aa  351  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3613  Ribulose-phosphate 3-epimerase  78.28 
 
 
221 aa  344  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  75 
 
 
221 aa  336  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.51 
 
 
214 aa  284  9e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.55 
 
 
214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0604  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.84 
 
 
247 aa  282  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000939667  normal  0.65152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  66.03 
 
 
214 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.89 
 
 
238 aa  279  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2848  Ribulose-phosphate 3-epimerase  64.15 
 
 
220 aa  278  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.19951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3247  ribulose-phosphate 3-epimerase  64.15 
 
 
220 aa  278  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.43 
 
 
235 aa  277  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  62.56 
 
 
224 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.98 
 
 
230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  59.72 
 
 
220 aa  271  7e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2229  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.3 
 
 
219 aa  269  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.561803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.55 
 
 
224 aa  269  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.56 
 
 
222 aa  268  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.04 
 
 
235 aa  268  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.03 
 
 
221 aa  268  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.96 
 
 
216 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3229  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
235 aa  266  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4082  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 
224 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.349999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4115  Ribulose-phosphate 3-epimerase  63.08 
 
 
224 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0155127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1619  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
234 aa  264  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1646  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.57 
 
 
234 aa  264  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  61.86 
 
 
219 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.41 
 
 
218 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1252  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.24 
 
 
227 aa  261  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.65 
 
 
232 aa  260  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 
220 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1230  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.41 
 
 
221 aa  258  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.942402  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 
223 aa  257  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 
218 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.48 
 
 
234 aa  256  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16821  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.88 
 
 
264 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2834  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  60.09 
 
 
230 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72557  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
243 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.91 
 
 
226 aa  252  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.14 
 
 
227 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
228 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
228 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
228 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
228 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.32 
 
 
229 aa  251  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  55.76 
 
 
231 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.07 
 
 
228 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09961  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.54 
 
 
221 aa  250  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.469289  normal  0.317171 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  57.41 
 
 
265 aa  250  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4601  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
225 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.361738  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.77 
 
 
230 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 
238 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  58.49 
 
 
225 aa  247  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.21 
 
 
227 aa  247  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46660  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.87 
 
 
224 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  54.84 
 
 
224 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.69 
 
 
219 aa  245  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3879  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.55 
 
 
225 aa  245  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.753012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  57.48 
 
 
239 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0327  Ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0327  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.204958  normal  0.201128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0229  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
225 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0846712  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3855  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3962  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
225 aa  245  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0524071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0924  ribulose-phosphate 3-epimerase  59.71 
 
 
231 aa  245  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3723  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.14 
 
 
225 aa  245  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00616256  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  245  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.82 
 
 
223 aa  244  6e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  244  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  244  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4056  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.08 
 
 
225 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00103124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3700  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.87 
 
 
236 aa  244  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3692  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 
225 aa  244  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4077  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 
224 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.87 
 
 
223 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2230  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  58.45 
 
 
227 aa  243  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.375841  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0346  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3799  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.35 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0860843 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  56.87 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0292  ribulose-phosphate 3-epimerase  56.4 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2492  ribulose-phosphate 3-epimerase  57.75 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>