More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1620 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  84.34 
 
 
282 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0324  band 7 protein  67.5 
 
 
284 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0321  band 7 protein  67.5 
 
 
284 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  68.21 
 
 
283 aa  397  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  67.5 
 
 
284 aa  396  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4626  band 7 protein  54.77 
 
 
284 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.137042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.56 
 
 
286 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4712  band 7 protein  54.06 
 
 
284 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.21194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4834  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.06 
 
 
284 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.220458  normal  0.54169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4890  band 7 protein  54.06 
 
 
284 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2364  band 7 protein  55.27 
 
 
286 aa  328  9e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0649  putative membrane protease subunit-like protein  55.17 
 
 
291 aa  321  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.384803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  54.84 
 
 
289 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  56.99 
 
 
286 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2127  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.58 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.458205  normal  0.678014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2451  band 7 protein  54.58 
 
 
286 aa  312  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0086  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.85 
 
 
281 aa  299  4e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  48.89 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  42.96 
 
 
304 aa  244  8e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  41.69 
 
 
319 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  43.4 
 
 
336 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  43.68 
 
 
331 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  43.6 
 
 
344 aa  228  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  43.68 
 
 
336 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  42.96 
 
 
329 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  44.27 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.7 
 
 
309 aa  221  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  39.38 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.3 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  40.83 
 
 
318 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  42.91 
 
 
346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4267  band 7 protein  41.24 
 
 
329 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  40.6 
 
 
326 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  42.75 
 
 
334 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  42.91 
 
 
332 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.71 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.41 
 
 
334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.03 
 
 
328 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.37 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  39.32 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  42.18 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  38.62 
 
 
305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  38.62 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  38.62 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  38.62 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.52 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  38.62 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0070  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.66 
 
 
328 aa  211  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.255866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.02 
 
 
305 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  42.18 
 
 
345 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  40.14 
 
 
306 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  38.62 
 
 
304 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  38.14 
 
 
301 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.25 
 
 
311 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  37.59 
 
 
304 aa  204  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  40.21 
 
 
305 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0280  integral membrane protein  40.07 
 
 
307 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  40.21 
 
 
304 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  37.02 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  37.02 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  37.02 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  39.79 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2735  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.42 
 
 
319 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  38.91 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0038  hypothetical protein  38.64 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  39.35 
 
 
356 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0571  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.52 
 
 
306 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  39.86 
 
 
403 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  38.64 
 
 
304 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  37.89 
 
 
394 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  39.08 
 
 
369 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2501  band 7 protein  40.82 
 
 
406 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  39.08 
 
 
369 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  40.22 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.57 
 
 
359 aa  188  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  37.58 
 
 
326 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  39.58 
 
 
429 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  40.22 
 
 
304 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.76 
 
 
318 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.89 
 
 
376 aa  185  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.47 
 
 
314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  40.38 
 
 
439 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  39.85 
 
 
360 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  36.96 
 
 
401 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  34.54 
 
 
326 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  38.91 
 
 
398 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.91 
 
 
328 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  35.48 
 
 
327 aa  181  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  37.63 
 
 
327 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  37.15 
 
 
456 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  36.04 
 
 
473 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  37.02 
 
 
402 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>