More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1092 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  64.18 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  64.65 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  65.33 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  62.8 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  64.68 
 
 		 230 aa  235  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  60.68 
 
 		 208 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  58.45 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  54.97 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  52.66 
 
 		 254 aa  204  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  51.79 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  53.57 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  48.56 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 257 aa  197  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  48.74 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  50.75 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  55.33 
 
 		 260 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  48.44 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.11 
 
 		 214 aa  192  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 253 aa  191  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  46.73 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  52.6 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3310  Ribonuclease H  51.3 
 
 		 207 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 227 aa  187  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  53.16 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  52.63 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.45 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4366  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  52.94 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  54.82 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  54.82 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  55 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.85 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.5 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1368  Ribonuclease H  52.31 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  41.67 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  48.72 
 
 		 308 aa  181  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 268 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  51.05 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  48.36 
 
 		 257 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  51.52 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  51.28 
 
 		 259 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 283 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1791  Ribonuclease H  52.79 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  46.54 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  50 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  49.48 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  47.95 
 
 		 257 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  53.61 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  51.38 
 
 		 207 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  47.18 
 
 		 283 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  46.95 
 
 		 257 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  52.58 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 211 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  50.83 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  50.55 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  47.8 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  41.33 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  49.47 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  45.6 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  51.65 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  49.23 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.31 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  51.93 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  50.56 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  48.35 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  51.67 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.28 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  47.15 
 
 		 238 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  47.31 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  46.41 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2303  ribonuclease HII  53.72 
 
 		 195 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000380421  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.28 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  46.77 
 
 		 206 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  45.37 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>