More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1227 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1227  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.756044  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  69.4 
 
 		 150 aa  189  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 		 133 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  56.39 
 
 		 140 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  51.49 
 
 		 137 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 171 aa  72  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  35.57 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  31.75 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 136 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.09 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  33.33 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  31.93 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  38.6 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 229 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  37.86 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  34.23 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  37.61 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 		 136 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  29.75 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  34.45 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  33.62 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  36.27 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  36.27 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  33.63 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33.98 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  31.2 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  34.83 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1456  MutT/nudix family protein  28.79 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000100507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.86 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  35.35 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  35.35 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  29.45 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  31.51 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  33.59 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>