More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1507 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  815    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 420 aa  350  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  47.33 
 
 		 417 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 440 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  46.82 
 
 		 411 aa  342  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  44.33 
 
 		 422 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  46.46 
 
 		 420 aa  300  4e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 417 aa  282  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  44.56 
 
 		 422 aa  279  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  47.36 
 
 		 415 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  46.55 
 
 		 423 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 402 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 419 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 403 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  32.5 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 418 aa  112  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 449 aa  96.7  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0609  major facilitator superfamily transporter  24.15 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.59 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  30.56 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  20.11 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0574  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0628  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0569  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.676652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  24.57 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  27.74 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  30.56 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4025  major facilitator superfamily fosmidomycin resistant protein  23.84 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.164373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2632  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224364  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0567  major facilitator family transporter  24.35 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0817  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  23.55 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0023  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  28.18 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.53 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  24.49 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  24.16 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  30.18 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  29.86 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1326  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686197  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  23.21 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  22.87 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>