More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0638 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  83.41 
 
 		 416 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  82.21 
 
 		 416 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  81.97 
 
 		 416 aa  699    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  83.65 
 
 		 416 aa  708    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  81.97 
 
 		 416 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  82.45 
 
 		 416 aa  701    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  80.76 
 
 		 423 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  83.17 
 
 		 416 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  83.89 
 
 		 416 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  83.65 
 
 		 416 aa  715    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  862    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  82.65 
 
 		 417 aa  704    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  82.45 
 
 		 416 aa  701    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  79.1 
 
 		 423 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  74.16 
 
 		 425 aa  624  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  596  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  64.42 
 
 		 415 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  67.4 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  66.11 
 
 		 415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  68.99 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  68.75 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  65.07 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 425 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  64.83 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  63.88 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  64.83 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  64.11 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  64.75 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  63.4 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  63.17 
 
 		 412 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  62.2 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  61.3 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  60.58 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  60.58 
 
 		 429 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  56.28 
 
 		 410 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  55.18 
 
 		 410 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  54.5 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  74.05 
 
 		 290 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  51.32 
 
 		 409 aa  431  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  62.39 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  50.61 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.99 
 
 		 284 aa  309  6.999999999999999e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1218  formyl-coenzyme A transferase  97.44 
 
 		 117 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.437775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.08 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.07 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.45 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.75 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.38 
 
 		 419 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  33.9 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.95 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3835  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.55 
 
 		 811 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.61 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3762  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.55 
 
 		 811 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.51 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.97 
 
 		 412 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.89 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3774  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.31 
 
 		 811 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199117  normal  0.974632 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  32.94 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 		 395 aa  206  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.88 
 
 		 407 aa  206  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4517  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.25 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  31.88 
 
 		 404 aa  204  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  31.16 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  31.43 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2644  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.17 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6435  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.32 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145178 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  30.22 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.78 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  30.66 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2979  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.475368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  33.17 
 
 		 419 aa  199  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03190  expressed protein  32.17 
 
 		 450 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3871  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.68 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.39623  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  30.71 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  32.95 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  31.06 
 
 		 402 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  31.49 
 
 		 393 aa  196  6e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  31.15 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5552  putative formyl-coenzyme A transferase  32.78 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  30.22 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  32.54 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  30.33 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.93 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.47 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0816  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.89 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  29.95 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3330  formyl-CoA transferase  29.48 
 
 		 411 aa  192  8e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  30.42 
 
 		 427 aa  192  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1429  CAIB/BAIF family protein  30.85 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.587908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>