236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3511 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  100 
 
 
255 aa  520  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  88.63 
 
 
255 aa  467  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  74.7 
 
 
258 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  74.7 
 
 
258 aa  388  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  72.83 
 
 
254 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  73.12 
 
 
256 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  72.33 
 
 
255 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  70.12 
 
 
256 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  65.61 
 
 
254 aa  345  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  64.45 
 
 
284 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  62.5 
 
 
262 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  38.87 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  37.45 
 
 
238 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  39.22 
 
 
245 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  36.47 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  32.62 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  33.59 
 
 
262 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  33.2 
 
 
262 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  33.2 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  33.46 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  33.07 
 
 
265 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  33.07 
 
 
265 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  32.71 
 
 
270 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.33 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  32.68 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  32.58 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  33.97 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  33.97 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  33.97 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  33.97 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  33.97 
 
 
256 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  33.59 
 
 
259 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  33.97 
 
 
256 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  28.79 
 
 
266 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.73 
 
 
295 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  33.92 
 
 
277 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  34.02 
 
 
244 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  32.48 
 
 
293 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  31.77 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  33.33 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  29.08 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  30.94 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  31.45 
 
 
275 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  29.62 
 
 
256 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  29.34 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.7 
 
 
269 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  30.28 
 
 
249 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.13 
 
 
245 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  29.92 
 
 
251 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  30.4 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.97 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0974  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.74 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.158995  normal  0.397357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  28.85 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  29.48 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  28.63 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  28.57 
 
 
242 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  25.49 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  38.12 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  26.17 
 
 
279 aa  79  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  30.12 
 
 
242 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.76 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  33.71 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  28.22 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  27.21 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  25.28 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  26.91 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  25.86 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  30.12 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  25.76 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.93 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  31.36 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  29.05 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  31.46 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  30.62 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.62 
 
 
255 aa  72  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  31.55 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  27.1 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  33.59 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  30.34 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.27 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  31.4 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  29.78 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  37.06 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  24.81 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  34.46 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  26.77 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02843  pantothenate kinase  28.29 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  33.54 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  28.31 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.84 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  26.2 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  26.37 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  33.33 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00931  transcriptional regulator  24.39 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  26.57 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  30.48 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  28.96 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  27.21 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  30.94 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>