More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2216 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  83.17 
 
 		 420 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 411 aa  801    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  70.6 
 
 		 417 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  46.82 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  54.48 
 
 		 440 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  47.56 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  44.81 
 
 		 422 aa  296  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  46.33 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  46.86 
 
 		 417 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  46.11 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  44.18 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 396 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  35.12 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  32.55 
 
 		 405 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  29.04 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2104  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5829  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.50804  normal  0.878008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0958  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  29.88 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4588  major facilitator transporter  30 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0474  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.812694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1830  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414074  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0720  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00588429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0156  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0711095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0701  MFS efflux transporter, putative  32.47 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2972  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0735  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  32.57 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0734  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3799  fosmidomycin resistance protein  28.25 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.319996  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  27.54 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.03 
 
 		 531 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1260  fosmidomycin resistance protein  27.88 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0237353  hitchhiker  0.0000222003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  27.88 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6505  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1115  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0518  fosmidomycin resistance protein  29.45 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1681  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0414  fosmidomycin resistance protein  28.57 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0053  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_004310  BR0656  fosmidomycin resistance protein  28.65 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.231636  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0649  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.298965  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6092  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0523  fosmidomycin resistance protein  28.74 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3645  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0571  fosmidomycin resistance protein  28.74 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.652835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2794  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.572754  normal  0.513078 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6287  major facilitator superfamily permease  29.47 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.53503  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00430  predicted fosmidomycin efflux system  28.83 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3131  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1422  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0556  fosmidomycin resistance protein  28.83 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4757  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54337  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254486  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4483  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.706987 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0962  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2458  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1871  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.565485  hitchhiker  0.00660368 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3137  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.546423  hitchhiker  0.000000426482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1444  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00435  hypothetical protein  28.83 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4326  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0412  putative fosmidomycin resistance antibiotic resistance transmembrane protein  28.28 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  normal  0.519743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  24.07 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0102  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.346364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6429  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2341  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0724  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.99 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  26.52 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  26.52 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>