More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0635 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0635  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000201895  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  34.08 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  35.87 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.9 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  32.9 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  32.58 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  36.04 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  36.67 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.21 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.51 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  34.33 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  29.26 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  29.79 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  31.58 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  32.1 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 258 aa  109  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  31.62 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.38 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  32.38 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  30.39 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  32.59 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  29.57 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  32.31 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  30.6 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4020  transcriptional regulator, DeoR family  33.04 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  28.15 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  28.14 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  30.96 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  31.11 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3454  transcriptional regulator, DeoR family  31.28 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  30.42 
 
 		 261 aa  99.4  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0079  putative transcriptional regulator IolR  33.02 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  31.09 
 
 		 264 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  29 
 
 		 268 aa  99  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  33.33 
 
 		 230 aa  98.6  8e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 251 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  27.35 
 
 		 262 aa  98.6  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  29.61 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  29.61 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  31.76 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  30.36 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  29.18 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0321  transcriptional regulator, DeoR family  30.52 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  29.18 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>