More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0930 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  100 
 
 		 306 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  63.28 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  62.3 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  50 
 
 		 310 aa  290  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  40.51 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  45.95 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  43.33 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  42.51 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  42.16 
 
 		 369 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  38.82 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  44.63 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  39.14 
 
 		 299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  37.83 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  41.6 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  39.2 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.68 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  43.42 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  42.62 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  37.38 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  42.62 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  41.25 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  42.62 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  42.32 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  40.77 
 
 		 313 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  41.08 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  41.08 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  41.08 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  41.08 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.89 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  37.38 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  33.44 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  37.63 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  37.62 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  37.42 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  37.42 
 
 		 320 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  38.94 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  39.74 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  40.81 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.89 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  36.16 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  40.71 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  36.73 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  40.27 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.97 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  37.05 
 
 		 319 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.37 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  33.68 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  30.97 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  32.05 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37.89 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  45.45 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  55.36 
 
 		 541 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  29.6 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  35.27 
 
 		 384 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.52 
 
 		 328 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50 
 
 		 443 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  42.55 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.17 
 
 		 445 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.42 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  45.8 
 
 		 656 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  54.31 
 
 		 379 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.78 
 
 		 423 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  48.76 
 
 		 621 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.81 
 
 		 430 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  40 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  45.26 
 
 		 615 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  35.68 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  40.41 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.34 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  37.34 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.5 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  50.86 
 
 		 400 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  46.15 
 
 		 387 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  37.34 
 
 		 442 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.53 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.66 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.19 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.36 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  49.14 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.75 
 
 		 527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  33.47 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.88 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  38.65 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  48.28 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  41.79 
 
 		 430 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.67 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.88 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.28 
 
 		 468 aa  112  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  39.58 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44 
 
 		 312 aa  112  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  39.26 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  42.68 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  34.8 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  46.15 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.08 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.54 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  41.61 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.78 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.69 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  45.39 
 
 		 273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>