More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1420 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  67.62 
 
 
561 aa  786    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  65.53 
 
 
559 aa  765    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  100 
 
 
560 aa  1149    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  66.42 
 
 
562 aa  795    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  64.94 
 
 
559 aa  762    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  69 
 
 
567 aa  833    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  67.2 
 
 
572 aa  803    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  39.3 
 
 
600 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  38.99 
 
 
628 aa  428  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  39.5 
 
 
593 aa  419  1e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  39.81 
 
 
545 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  38.18 
 
 
608 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  39.26 
 
 
596 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  40.18 
 
 
594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.97 
 
 
538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  28.7 
 
 
533 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.41 
 
 
540 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  29.37 
 
 
546 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
538 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  27.96 
 
 
534 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
539 aa  178  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
559 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.02 
 
 
540 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 
576 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
551 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
563 aa  150  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.87 
 
 
511 aa  135  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 
617 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  26.08 
 
 
557 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  24.29 
 
 
573 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.24 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  25.18 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.42 
 
 
511 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.66 
 
 
524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0639  extracellular solute-binding protein family 5  25.23 
 
 
580 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 
544 aa  127  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 
509 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  22.91 
 
 
510 aa  124  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
544 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 
584 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  26.55 
 
 
622 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.31 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  27.03 
 
 
495 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  24.13 
 
 
535 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  24.13 
 
 
535 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  24.13 
 
 
535 aa  121  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  24.77 
 
 
535 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 
588 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 
505 aa  120  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 
526 aa  120  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
512 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1185  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 
532 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
498 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.27 
 
 
535 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.42 
 
 
542 aa  118  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1356  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
596 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  23.18 
 
 
526 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.18 
 
 
526 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.18 
 
 
526 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.18 
 
 
526 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 
618 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
639 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  23.18 
 
 
526 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 
545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0563  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 
536 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0406443  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.84 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  25.43 
 
 
607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0892  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 
593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.55 
 
 
532 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.84 
 
 
511 aa  115  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2583  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.68 
 
 
524 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0432339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 
866 aa  114  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 
535 aa  113  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  24.37 
 
 
524 aa  113  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.55 
 
 
520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 
535 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6955  oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  25.71 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  23.4 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5370  extracellular solute-binding protein family 5  23.22 
 
 
629 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  25.24 
 
 
607 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  22.59 
 
 
535 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  24.95 
 
 
531 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  23.66 
 
 
534 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  26.51 
 
 
541 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.78 
 
 
589 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  22.16 
 
 
575 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  22.43 
 
 
535 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.26 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0391  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 
522 aa  110  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4579  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 
596 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  22.41 
 
 
575 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  25.82 
 
 
502 aa  110  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 
528 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0671  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 
534 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  23.01 
 
 
556 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>