73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0260 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 346 aa  713    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  68.06 
 
 		 346 aa  504  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  64.35 
 
 		 357 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  62.72 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  64.18 
 
 		 346 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  62.69 
 
 		 348 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  61.85 
 
 		 349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  26.65 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  25.61 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  27.17 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  27.97 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  25.82 
 
 		 339 aa  96.7  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  24.47 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  23.86 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 341 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  26.3 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.84 
 
 		 338 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  28.24 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  26.99 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.53 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.26 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  22.29 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.22 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  24.57 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  24.44 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_002950  PG0949  hypothetical protein  24.69 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.148514 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  27.5 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  22.66 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  25.84 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  21.75 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.11 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  23.8 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  24.4 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2001  DNA polymerase III, delta subunit  21.07 
 
 		 341 aa  58.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  24.63 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  24.33 
 
 		 336 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  27.14 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.33 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  26.51 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  24.48 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  26.53 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.96 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 330 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  26.18 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  23.43 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  25.88 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  25.32 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  22.32 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  22.56 
 
 		 337 aa  46.2  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0811  DNA polymerase III, delta subunit  31.78 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.692629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  23.25 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08980  DNA polymerase III subunit delta  25.89 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0881789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  23.73 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  22.66 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  25.1 
 
 		 345 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  24.69 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  21.05 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0729  hypothetical protein  21.2 
 
 		 338 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0375317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>