More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4100 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4100  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 441 aa  897    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1530  FAD linked oxidase domain protein  32.87 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.843901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3362  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.57 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5002  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.56 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.27379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4144  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.49 
 
 		 428 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0286826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3390  FAD linked oxidase domain protein  41 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.56 
 
 		 876 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5351  FAD linked oxidase domain protein  28.23 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  33.33 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1718  glycolate oxidase subunit GlcE  42.2 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0352  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.44 
 
 		 437 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.93914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  34.88 
 
 		 421 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2054  FAD linked oxidase-like  42.35 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.273345  normal  0.646851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2259  FAD linked oxidase-like protein  37.02 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0329994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1137  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.96 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1663  glycolate oxidase, subunit GlcE  35.34 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2220  glycolate oxidase FAD binding subunit  30.86 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1828  FAD linked oxidase-like  34.4 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.850639  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4800  FAD linked oxidase domain protein  32.17 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1981  FAD linked oxidase domain protein  39.88 
 
 		 440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101076  normal  0.0330309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4556  FAD linked oxidase-like  47.86 
 
 		 431 aa  116  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1954  FAD linked oxidase domain protein  39.88 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  31.38 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3046  FAD linked oxidase domain protein  39.18 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0338046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2952  FAD linked oxidase domain protein  39.18 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2866  FAD linked oxidase-like  42.36 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02310  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  45.52 
 
 		 379 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165714  normal  0.900052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1892  FAD linked oxidase domain protein  41.99 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3272  FAD linked oxidase domain protein  39.67 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0416233  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2920  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.02 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.411687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1916  FAD linked oxidase domain protein  31.58 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000270596  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4735  FAD linked oxidase-like  40.79 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.581716 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6393  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.35 
 
 		 355 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4136  FAD linked oxidase-like  33.33 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.711925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0038  FAD linked oxidase-like  33.01 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839008  hitchhiker  0.0000133751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43320  glycolate oxidase FAD binding subunit  28.5 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.972909  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0140  oxidase, FAD-binding  32 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0313  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 		 461 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000316331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1267  FAD linked oxidase domain protein  35.14 
 
 		 406 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.606342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5974  FAD linked oxidase domain protein  42.86 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2158  glycolate oxidase FAD binding subunit  41.78 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3746  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.97 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2580  FAD linked oxidase  42.34 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0187  putative glycolate oxidase subunit GlcE  40.46 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2367  FAD linked oxidase domain protein  34.52 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2017  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.97 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.68 
 
 		 357 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0157  putative glycolate oxidase subunit GlcE  50 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.596412  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1322  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2688  glycolate oxidase FAD binding subunit  38.89 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.87323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0395  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.47 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.395676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3203  FAD linked oxidase-like  37.33 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1234  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.09 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2305  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.89 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1900  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.43 
 
 		 437 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  28.25 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25811  putative glycolate oxidase subunit GlcE  43.41 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3332  glycolate oxidase FAD binding subunit  44.88 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196068  decreased coverage  0.000126802 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2201  glycolate oxidase FAD binding subunit  40.28 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.647305  normal  0.565605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  29.11 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0495  FAD linked oxidase domain protein  40.56 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.220938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0681  FAD linked oxidase domain protein  44.07 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.28978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5642  glycolate oxidase FAD binding subunit  42.19 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  35.15 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.15 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  34.55 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  31.38 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  34.55 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  35.37 
 
 		 499 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0184  FAD linked oxidase domain protein  30.35 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0232347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.67 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0166  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.35 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.18 
 
 		 461 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7455  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.43 
 
 		 358 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0108984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  28.39 
 
 		 472 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  28.81 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1361  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  34.76 
 
 		 474 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  32.93 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0310  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  32.75 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0305  glycolate oxidase subunit-like protein ysfC  32.75 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 473 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3556  glycolate oxidase, subunit GlcE  42.52 
 
 		 352 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084047  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4787  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.28 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231636  normal  0.59925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.47 
 
 		 457 aa  98.2  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2679  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.78 
 
 		 358 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.75 
 
 		 461 aa  97.4  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  31.95 
 
 		 474 aa  97.8  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0202  glycolate oxidase FAD binding subunit  39.85 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.435093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1019  putative glycolate oxidase subunit protein  35.78 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0032  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.49 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  34.38 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.33027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>