62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2733 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1080    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  37.18 
 
 		 608 aa  290  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  29.52 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  29.14 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  29.56 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  28.15 
 
 		 441 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  26.5 
 
 		 489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  23.42 
 
 		 934 aa  106  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  25.06 
 
 		 437 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  24.83 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  27.4 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  21.73 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  24.7 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 		 490 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  22.14 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  28.5 
 
 		 1812 aa  58.2  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3105  Pyrrolo-quinoline quinone  23.99 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  33.02 
 
 		 541 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  19.63 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  20.49 
 
 		 407 aa  50.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  26.7 
 
 		 1300 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  32.52 
 
 		 720 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.82 
 
 		 396 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  24.64 
 
 		 716 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  25.1 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  24.56 
 
 		 797 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1720  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.7 
 
 		 350 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363455 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1833  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.66 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6270  Pyrrolo-quinoline quinone  24.4 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1747  Pyrrolo-quinoline quinone  26.7 
 
 		 381 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.698447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1809  Pyrrolo-quinoline quinone  24.4 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  30 
 
 		 737 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1466  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.18 
 
 		 381 aa  47.4  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  27.32 
 
 		 834 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2187  PQQ repeat-containing protein  23.27 
 
 		 381 aa  47  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.508226  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1832  putative lipoprotein  23.27 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.999368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1342  putative lipoprotein  23.02 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2351  PQQ repeat-containing protein  23.27 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5110  Pyrrolo-quinoline quinone  26.7 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.205621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0065  putative lipoprotein  23.27 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0585728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2225  PQQ repeat-containing protein  23.27 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1104  putative lipoprotein  23.27 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  29 
 
 		 618 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 820 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1375  MoxR-like ATPases-like  24.84 
 
 		 1238 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00027114  hitchhiker  0.0024969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  34.12 
 
 		 448 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  26.74 
 
 		 809 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0299  methanol dehydrogenase protein, large subunit, putative  27.14 
 
 		 619 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0065801  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  23.89 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2237  putative lipoprotein  23.16 
 
 		 381 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  23.89 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  26.17 
 
 		 708 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.36 
 
 		 386 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.19 
 
 		 411 aa  44.3  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  32.18 
 
 		 577 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  20.39 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  23.88 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  27.67 
 
 		 579 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  28.37 
 
 		 563 aa  43.9  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  22.86 
 
 		 475 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  28.68 
 
 		 601 aa  43.5  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.89 
 
 		 2272 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>