52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2820 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2820  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.310679  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1923  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 770 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  34.44 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1157  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1711  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.195446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1053  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  0.0546108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5173  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  29.9 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 201 aa  42.4  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  28.5 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5023  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 209 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 212 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 205 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 212 aa  42  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 98 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>