More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2381 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 256 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  45 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  43.33 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  45.1 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  41.73 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 123 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 206 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 209 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  40.35 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  36.67 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  38.89 
 
 		 204 aa  90.5  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  41.59 
 
 		 211 aa  90.1  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0944  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 220 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  87.8  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6494  response regulator receiver protein  45.38 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 230 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  38.98 
 
 		 209 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  37.61 
 
 		 202 aa  85.5  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  37.82 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 207 aa  84.7  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  39.82 
 
 		 212 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  36.52 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  38.94 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  35.19 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0583  response regulator receiver protein  41.12 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  34.91 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 240 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  35.34 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  35.9 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>