231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1019 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  100 
 
 
500 aa  980    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  45.68 
 
 
505 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  31.86 
 
 
485 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  28.78 
 
 
486 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  30.27 
 
 
482 aa  177  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  27.94 
 
 
503 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.16 
 
 
460 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.7 
 
 
460 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  26.12 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.46 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  26.98 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.33 
 
 
469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.17 
 
 
471 aa  126  9e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  27.29 
 
 
475 aa  117  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.16 
 
 
544 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.81 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.62 
 
 
457 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
475 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.26 
 
 
447 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  25.21 
 
 
511 aa  107  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.84 
 
 
552 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  33.84 
 
 
552 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.14 
 
 
472 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  26.14 
 
 
464 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  28.21 
 
 
445 aa  101  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  21.78 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
495 aa  89  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  23.24 
 
 
486 aa  88.6  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.61 
 
 
480 aa  87  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.73 
 
 
479 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  20.89 
 
 
467 aa  85.9  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.28 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  22.99 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.5 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.95 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  22.3 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  25.26 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  33.33 
 
 
460 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.95 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.33 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.76 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.98 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  24.16 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  26.12 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  24.77 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.53 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
457 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.79 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  25.06 
 
 
480 aa  78.2  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  22.06 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  24.32 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.38 
 
 
475 aa  77.4  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.75 
 
 
442 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.42 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.7 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.46 
 
 
477 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.42 
 
 
441 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.75 
 
 
463 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  27.52 
 
 
497 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.8 
 
 
465 aa  75.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  23.8 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  21.11 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.85 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.51 
 
 
481 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.17 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.25 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  27.22 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  28.99 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.74 
 
 
465 aa  73.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  27.22 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  27.22 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.88 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  24.1 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.96 
 
 
475 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.81 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  27.81 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  20.74 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  27.15 
 
 
460 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  20.74 
 
 
481 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
476 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  23.61 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  24.88 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  28.57 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  28.57 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.34 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  22.01 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  28.57 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  28.57 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  33.04 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  24.88 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  24.88 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  23.64 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  24.88 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  27.81 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  33.83 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>