114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0839 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0841  hypothetical protein  62.66 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0895  hypothetical protein  47.44 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2218  hypothetical protein  37.99 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1410  hypothetical protein  34.81 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0072  hypothetical protein  35.91 
 
 		 190 aa  101  7e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1149  hypothetical protein  30.82 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1402  hypothetical protein  31.22 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.394678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3055  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1952  hypothetical protein  31.32 
 
 		 192 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_004310  BR0582  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0921735  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0582  hypothetical protein  33.16 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3507  hypothetical protein  31.32 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.315458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2678  hypothetical protein  32.46 
 
 		 200 aa  85.5  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0882  hypothetical protein  30.82 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314045  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1663  protein of unknown function DUF1214  30.73 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2072  protein of unknown function DUF1214  30.19 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  35.12 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1786  hypothetical protein  30.52 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.347459  normal  0.0683375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0863  protein of unknown function DUF1214  33.95 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0927  hypothetical protein  32.72 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0888  protein of unknown function DUF1214  32.72 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0719  protein of unknown function DUF1214  36.57 
 
 		 237 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1116  hypothetical protein  35.29 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.521677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0877  hypothetical protein  30.63 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.000472414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1632  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.208054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  35.97 
 
 		 436 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  32.87 
 
 		 464 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  34.67 
 
 		 469 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  31.54 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  34.72 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  30.14 
 
 		 445 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  35.86 
 
 		 459 aa  62  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  34.03 
 
 		 482 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  30.92 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  33.1 
 
 		 437 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  30.34 
 
 		 435 aa  61.6  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  27.81 
 
 		 484 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  33.77 
 
 		 445 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  33.1 
 
 		 445 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  32.47 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  32.41 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0893  protein of unknown function DUF1214  26.42 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.547941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  32.74 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  31.29 
 
 		 481 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  29.1 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  32.65 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  34 
 
 		 482 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1322  hypothetical protein  31.53 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  32.64 
 
 		 436 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1021  protein of unknown function DUF1214  25.79 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  31.38 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  27.95 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  30.67 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  31.93 
 
 		 465 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  29.45 
 
 		 476 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  32.39 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  36.8 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  32.87 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  29.14 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  32.86 
 
 		 477 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  28.22 
 
 		 490 aa  54.7  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0625  hypothetical protein  26.49 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.769425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  29.22 
 
 		 452 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  29.93 
 
 		 474 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  30.54 
 
 		 480 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3687  hypothetical protein  29.25 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  34.23 
 
 		 473 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  32.62 
 
 		 445 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  31.74 
 
 		 482 aa  52  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  27.59 
 
 		 462 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  29.73 
 
 		 466 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  35.77 
 
 		 473 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  32 
 
 		 480 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  26.71 
 
 		 488 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  33.79 
 
 		 488 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  26.47 
 
 		 291 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  32.37 
 
 		 427 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1293  protein of unknown function DUF1214  33.33 
 
 		 345 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282416  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  29.66 
 
 		 512 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4286  hypothetical protein  33.04 
 
 		 480 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4372  hypothetical protein  33.04 
 
 		 480 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0578425  normal  0.546982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  30.07 
 
 		 470 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1476  protein of unknown function DUF1214  32.39 
 
 		 336 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5159  hypothetical protein  29.35 
 
 		 344 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2722  hypothetical protein  27.27 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198072 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.02 
 
 		 461 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 479 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1083  protein of unknown function DUF1214  28.09 
 
 		 347 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  29.7 
 
 		 459 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  30.63 
 
 		 442 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  27.27 
 
 		 472 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5225  hypothetical protein  30.43 
 
 		 348 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582161  normal  0.233334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  29.55 
 
 		 798 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3377  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 499 aa  45.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5466  hypothetical protein  31.82 
 
 		 375 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0592  hypothetical protein  34.26 
 
 		 511 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.930976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  30.92 
 
 		 432 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  28.19 
 
 		 479 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>