More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0731 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0731  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.240935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11910  short chain dehydrogenase  54.31 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2738  short chain dehydrogenase  51.12 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2782  short chain dehydrogenase  51.12 
 
 		 282 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2768  short chain dehydrogenase  51.12 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682688  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1820  short chain dehydrogenase  49.14 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4322  short chain dehydrogenase  42.59 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0320  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.130238  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1892  short chain dehydrogenase  46.56 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0109425  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0407  short chain dehydrogenase  44.21 
 
 		 263 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0267  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1117  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0271  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0262  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0281  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.2907  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37360  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000340641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  40.88 
 
 		 248 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  37.77 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.57 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  33.33 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.94 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 315 aa  106  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 312 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.04 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.04 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0560563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.04 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 308 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 		 239 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 255 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.843425  normal  0.851299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 		 272 aa  102  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300242  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000963224  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.9 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  36.22 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl173  dehydrogenase  31.38 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.99 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2736  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  36.76 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.07 
 
 		 252 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  36.32 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.64 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  38.78 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>