More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0142 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  68.48 
 
 		 278 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  66.79 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  67.75 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  67.39 
 
 		 278 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  62.72 
 
 		 279 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  66.3 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  62.72 
 
 		 279 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  67.39 
 
 		 278 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  66.3 
 
 		 278 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  63.44 
 
 		 279 aa  361  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  64.47 
 
 		 278 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  63.97 
 
 		 269 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  61.73 
 
 		 281 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  62.01 
 
 		 279 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  63.6 
 
 		 269 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  60.58 
 
 		 270 aa  348  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  61.65 
 
 		 279 aa  347  8e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  62.87 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  60.93 
 
 		 279 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  63.6 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  63.24 
 
 		 269 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  62.77 
 
 		 270 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  63.6 
 
 		 269 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  60.57 
 
 		 279 aa  345  5e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  61.03 
 
 		 268 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  61.76 
 
 		 269 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  63.84 
 
 		 272 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  60.79 
 
 		 280 aa  340  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  66.06 
 
 		 281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  63.74 
 
 		 275 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  62.32 
 
 		 277 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  60.43 
 
 		 280 aa  338  9e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  67.51 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  59.93 
 
 		 268 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  62.96 
 
 		 267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  60.29 
 
 		 278 aa  329  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  65.76 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  65.76 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  60.81 
 
 		 279 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  63.1 
 
 		 263 aa  323  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  63.42 
 
 		 263 aa  314  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  59.34 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  57.25 
 
 		 271 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  56.2 
 
 		 265 aa  275  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  55.72 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  53.31 
 
 		 274 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 276 aa  258  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 271 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  48.51 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  51.66 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  44.89 
 
 		 265 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  43.98 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  47.49 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  50.85 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  45.86 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  42.11 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1726  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195248  normal  0.0199144 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2068  tryptophan synthase subunit alpha  45.56 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.659301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  43.66 
 
 		 270 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  49.18 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1557  tryptophan synthase subunit alpha  45.82 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  43.51 
 
 		 272 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  44.32 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  49.37 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  44.87 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  46.86 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  47.99 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  44.58 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  45 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 265 aa  215  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  43.82 
 
 		 267 aa  215  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 267 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  44.35 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  42.68 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  45.57 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01272  tryptophan synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 273 aa  212  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 271 aa  211  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  46.3 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  42.26 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  43.51 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2304  tryptophan synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  39.63 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.67 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 265 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  46.69 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>