More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2425 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2425  gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
523 aa  1083    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679558 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0492  putative gamma-glutamyltranspeptidase  59.34 
 
 
522 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2054  gamma-glutamyltransferase  56.43 
 
 
528 aa  555  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.700984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0452  gamma-glutamyltransferase  54.79 
 
 
550 aa  552  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02495  gamma-glutamyltranspeptidase, putative  55.6 
 
 
525 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.528319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0905  Gamma-glutamyltransferase  49.8 
 
 
529 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0219  Gamma-glutamyltransferase  48.34 
 
 
530 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0302281 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3315  Gamma-glutamyltransferase  49.03 
 
 
531 aa  449  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0875  gamma-glutamyltransferase  48.15 
 
 
529 aa  451  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.935399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3471  Gamma-glutamyltransferase  47.95 
 
 
528 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2047  gamma-glutamyltransferase 2  47.12 
 
 
533 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  0.471768 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1433  gamma-glutamyltransferase  46.59 
 
 
527 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0189  gamma-glutamyltransferase  46.12 
 
 
536 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213833  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0445  gamma-glutamyltransferase  47.87 
 
 
532 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000532375  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4543  gamma-glutamyltransferase  47.58 
 
 
543 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.584488 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0930  gamma-glutamyltransferase  48.34 
 
 
528 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406923  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1050  gamma-glutamyltransferase 2  47.48 
 
 
522 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0525518  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0869  gamma-glutamyltransferase  45.32 
 
 
532 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.518363  hitchhiker  0.00515419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0829  Gamma-glutamyltransferase  46.11 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.622352  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1832  gamma-glutamyltranspeptidase  44.25 
 
 
550 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.905491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4891  gamma-glutamyltransferase  43.92 
 
 
532 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000372329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3809  gamma-glutamyltransferase  46.8 
 
 
532 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.342298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1413  gamma-glutamyltransferase  43.88 
 
 
531 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3118  Gamma-glutamyltransferase  45.86 
 
 
539 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436644 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0962  Gamma-glutamyltransferase  44.47 
 
 
531 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235425  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1030  gamma-glutamyltransferase  45.17 
 
 
625 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0870338  normal  0.115821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1157  Gamma-glutamyltransferase  44.86 
 
 
531 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605037  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0785  gamma-glutamyltranspeptidase  40.08 
 
 
539 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0928  gamma-glutamyltransferase  40.08 
 
 
539 aa  342  7e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3318  gamma-glutamyltransferase  41.44 
 
 
534 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1970  gamma-glutamyltransferase  38.12 
 
 
569 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0400507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4849  gamma-glutamyltransferase  37.74 
 
 
569 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5336  gamma-glutamyltransferase  37.43 
 
 
538 aa  332  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5252  gamma-glutamyltransferase  37.84 
 
 
528 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.82773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2100  gamma-glutamyltransferase  36.9 
 
 
540 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  37.03 
 
 
553 aa  302  1e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3832  gamma-glutamyltransferase  36.17 
 
 
524 aa  296  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2027  gamma-glutamyltransferase  38.01 
 
 
552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2160  gamma-glutamyltransferase  35.58 
 
 
513 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664975  normal  0.88097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  35.23 
 
 
533 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.72 
 
 
534 aa  240  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  33.01 
 
 
525 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1095  gamma-glutamyltransferase  33.46 
 
 
534 aa  227  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0208783  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  32.26 
 
 
533 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  31.98 
 
 
526 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  33.33 
 
 
543 aa  223  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2766  Gamma-glutamyltransferase  32.45 
 
 
542 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.186792  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6001  gamma-glutamyltransferase 2  32.46 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2362  Gamma-glutamyltransferase  32.26 
 
 
542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.306042 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2702  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 
546 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
536 aa  220  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2062  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 
546 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0267757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2673  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 
546 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.900835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2726  gamma-glutamyltransferase  32.4 
 
 
546 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3315  gamma-glutamyltransferase  32.51 
 
 
545 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106627  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  31.38 
 
 
533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0292  gamma-glutamyltransferase  33.59 
 
 
531 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.091673  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0589  gamma-glutamyltransferase 2  32.95 
 
 
538 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2598  gamma-glutamyltransferase  32.58 
 
 
546 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425689  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  32.94 
 
 
534 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  32.63 
 
 
525 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0822  gamma-glutamyltransferase 2  31.06 
 
 
541 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0495612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  32.57 
 
 
525 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0841  gamma-glutamyltransferase 2  31.25 
 
 
541 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6648  gamma-glutamyltransferase  32.32 
 
 
545 aa  210  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.46 
 
 
527 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.66 
 
 
538 aa  210  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2501  putative gamma-glutamyltranspeptidase protein  31.57 
 
 
552 aa  210  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.110727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2487  Gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 
539 aa  210  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.769591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0624  gamma-glutamyltransferase  31.14 
 
 
546 aa  210  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0644  gamma-glutamyltransferase 2  31.94 
 
 
545 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996931  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0119  gamma-glutamyltransferase  31.95 
 
 
539 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.505868 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.86 
 
 
538 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1894  Gamma-glutamyltransferase  33.78 
 
 
540 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.392686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  30.98 
 
 
537 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1163  gamma-glutamyltransferase  31.23 
 
 
529 aa  205  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2090  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 
542 aa  205  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.017049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4054  gamma-glutamyltransferase  30.93 
 
 
522 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  29.73 
 
 
561 aa  205  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  32.05 
 
 
531 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0878  gamma-glutamyltransferase  33.33 
 
 
503 aa  202  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0917  gamma-glutamyltransferase 2  31.98 
 
 
562 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 
525 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2846  gamma-glutamyltransferase  30.89 
 
 
539 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.576016  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1982  gamma-glutamyltransferase  31.06 
 
 
565 aa  200  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.576386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2197  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.47 
 
 
511 aa  200  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0911  gamma-glutamyltransferase 2  31.19 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0744  putative gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1819  gamma-glutamyltransferase 2  31.61 
 
 
539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432614 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0731  putative gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
557 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  31.04 
 
 
568 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  30.28 
 
 
593 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  32.7 
 
 
542 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0245  gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2457  gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0575232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  31.09 
 
 
536 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2376  gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2701  gamma-glutamyltransferase  31.19 
 
 
557 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0604  gamma-glutamyltransferase  30.99 
 
 
634 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1254  Gamma-glutamyltransferase  30.27 
 
 
537 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>