More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2009 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  100 
 
 
283 aa  566  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.91 
 
 
283 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.7 
 
 
282 aa  371  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.95 
 
 
283 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  63.25 
 
 
284 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.24 
 
 
283 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.24 
 
 
283 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.89 
 
 
283 aa  361  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.95 
 
 
283 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.89 
 
 
283 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.54 
 
 
283 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.54 
 
 
283 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
283 aa  358  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.48 
 
 
283 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.18 
 
 
283 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.66 
 
 
283 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.89 
 
 
283 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.89 
 
 
283 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.28 
 
 
282 aa  342  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.3 
 
 
283 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  57.24 
 
 
283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  56.89 
 
 
283 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  46.74 
 
 
291 aa  273  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.12 
 
 
289 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
305 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
286 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
304 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
307 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
314 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
303 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
285 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01770  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.57 
 
 
315 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.474975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
295 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
313 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
281 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.16 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
275 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
282 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
272 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.691915  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
284 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
292 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
281 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  36.72 
 
 
281 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  33.97 
 
 
281 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  33.22 
 
 
281 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
277 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  33.8 
 
 
281 aa  158  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
292 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
290 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.84 
 
 
278 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  35.13 
 
 
277 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
287 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
294 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.563894  hitchhiker  0.000776541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
274 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.364527  hitchhiker  0.005111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0466415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
307 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.402719  normal  0.159625 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
292 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
281 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
281 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  35.91 
 
 
295 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1958  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  33.71 
 
 
281 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126876  normal  0.322373 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
281 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.75 
 
 
312 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0602936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.228391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.68 
 
 
278 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  38.29 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  34.65 
 
 
271 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.74 
 
 
350 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
295 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
292 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
303 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
271 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
284 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.64 
 
 
302 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
271 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
281 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
281 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
281 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
287 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.68 
 
 
281 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
274 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0867  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.08 
 
 
293 aa  149  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409725  normal  0.329849 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
326 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
273 aa  148  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
320 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
284 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
274 aa  148  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.159934  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.23 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>