36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3253 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3253  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  100 
 
 		 523 aa  1076    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  normal  0.018694 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0016  Exo-alpha-sialidase  44.15 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1835  Exo-alpha-sialidase  39.81 
 
 		 674 aa  351  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2214  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  36.88 
 
 		 549 aa  319  6e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2856  Neuraminidase (sialidase)-like protein  45.63 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3447  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 559 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1703  Exo-alpha-sialidase  30.41 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.137706  normal  0.0157049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3020  Exo-alpha-sialidase  30.08 
 
 		 388 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000653205  normal  0.815446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0721  putative exo-alpha-sialidase  29.34 
 
 		 694 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_002950  PG0352  sialidase, putative  27.4 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0283127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1515  exo-alpha-sialidase  27.73 
 
 		 949 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3384  conserved repeat domain protein  29.19 
 
 		 978 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  32.79 
 
 		 1173 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0543  exo-alpha-sialidase  28.41 
 
 		 1015 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2223  Exo-alpha-sialidase  28.77 
 
 		 399 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0189  exo-alpha-sialidase  29.02 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5835  Exo-alpha-sialidase  27.3 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08300  BNR/Asp-box repeat protein  28.26 
 
 		 408 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.195911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3385  Exo-alpha-sialidase  29.81 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2227  hypothetical protein  28.12 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08290  hypothetical protein  28.41 
 
 		 377 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0551571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  28.61 
 
 		 419 aa  94.7  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0877  sialidase  30.54 
 
 		 382 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0420038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0985  sialidase  30.54 
 
 		 382 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00120415  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1932  neuraminidase-related protein  27.92 
 
 		 816 aa  83.2  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00773567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2712  hypothetical protein  27.33 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0471  BNR domain-containing protein  31.62 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1914  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0005  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 857 aa  62  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1440  Exo-alpha-sialidase  25.78 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.721919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1211  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 757 aa  48.5  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  27.4 
 
 		 652 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1436  neuramidase  23.58 
 
 		 367 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.816222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  21.89 
 
 		 823 aa  47.4  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>