249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5292 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  100 
 
 		 205 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  80.49 
 
 		 205 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  80 
 
 		 205 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  81.46 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  77.45 
 
 		 205 aa  328  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  80.49 
 
 		 204 aa  328  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  77.45 
 
 		 205 aa  327  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  77.94 
 
 		 205 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  77.45 
 
 		 205 aa  324  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  72.55 
 
 		 205 aa  307  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  72.2 
 
 		 205 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  61.27 
 
 		 205 aa  250  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  57.56 
 
 		 206 aa  240  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  58.05 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  57.07 
 
 		 206 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  57.07 
 
 		 206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  57.07 
 
 		 206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  57.07 
 
 		 206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  57.07 
 
 		 206 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  57.07 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  57.07 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  57.07 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  57.07 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  57.07 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  57.07 
 
 		 206 aa  237  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  57.56 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  57.56 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  56.59 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  56.59 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5624  Hemolysin III family protein, channel protein  55.39 
 
 		 205 aa  231  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  56.86 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  52.68 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3103  channel protein, hemolysin III family  54.41 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2738  channel protein, hemolysin III family  54.41 
 
 		 205 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0157  HylII  58.54 
 
 		 205 aa  204  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5210  HylII  55.39 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.611368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  49.01 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  50 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  46.53 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1076  hemolysin III family channel protein  45.41 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  43.56 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  46.57 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1686  hemolysin III family channel protein  49.01 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3228  channel protein, hemolysin III family  45.63 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  45.23 
 
 		 219 aa  168  4e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0148  hemolysin III protein  44.12 
 
 		 214 aa  168  5e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0839  hemolysin III family channel protein  44 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  46 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  44.12 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0131  hemolysin III family channel protein  43.63 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.192747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  44.06 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  43.56 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3992  channel protein, hemolysin III family  47.52 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000238096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  43.07 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  42.93 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1223  hemolysin III family channel protein  44.06 
 
 		 518 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743924  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  41.26 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0623  hemolysin III family channel protein  44.72 
 
 		 216 aa  157  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  41.29 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1644  hemolysin III family channel protein  44.06 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000192122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4053  channel protein, hemolysin III family  42 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2224  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000315085  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3100  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147044  hitchhiker  5.80051e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2271  hemolysin III  44.06 
 
 		 239 aa  154  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000142686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2087  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000145785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2027  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000762716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2025  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000478415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2268  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03992e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2241  hemolysin III  44.06 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000273402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2353  hemolysin III  44.55 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2066  hemolysin III family channel protein  44.06 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3326  hemolysin III family channel protein  42.36 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  43.14 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0747  Hly-III family protein  42.29 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.720334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0531  hemolysin III  43.94 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.666008 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2317  hemolysin III  43.75 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.177004  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  47.06 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2171  hemolysin III  41.18 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.255778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3552  hemolysin III family channel protein  44.94 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  44.06 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  39.52 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2360  channel protein, hemolysin III family  43 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1993  channel protein, hemolysin III family  43 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0837698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  40.59 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  40.1 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  42.08 
 
 		 219 aa  141  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  41.95 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  39.6 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  42.57 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0049  hemolysin III  38.61 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  37.8 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  41.58 
 
 		 219 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>