124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2823 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 472 aa  927    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1380  polysaccharide biosynthesis protein  32.96 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0611611  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 490 aa  107  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 494 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 502 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 503 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 487 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  25.13 
 
 		 507 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 508 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  22.7 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  22.53 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  22.46 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  25.2 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 510 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 479 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 489 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0382  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.399639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 488 aa  73.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 502 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  21.84 
 
 		 483 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  23.4 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  25.55 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  19.51 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  18.54 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 493 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  19.21 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.81 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.81 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.81 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.81 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  21.2 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.81 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  20.21 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  25 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  26.5 
 
 		 507 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1055  hypothetical protein  25.57 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  25.08 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  25.72 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  25 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  19.78 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 497 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  20 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  22.28 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  21.22 
 
 		 492 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2949  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.484076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  22.76 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  20.44 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  20.19 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  20.44 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  20.43 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  18.75 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  20.19 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  20.44 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2893  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  20.19 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  20.19 
 
 		 492 aa  57  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  23.54 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  26.09 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 482 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 504 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.24 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 		 501 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3400  polysaccharide biosynthesis protein  25.57 
 
 		 493 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.46143  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  20.4 
 
 		 482 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  21.64 
 
 		 492 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 		 424 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3381  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 494 aa  52.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0051743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 508 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3348  polysaccharide biosynthesis protein  22.91 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 		 484 aa  50.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2291  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1044  hypothetical protein  24.92 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 514 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>