283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3911 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3911  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2406  hypothetical protein  46.8 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104151 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1708  hypothetical protein  45.82 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.605822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2983  hypothetical protein  46.61 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2838  hypothetical protein  46.22 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2856  hypothetical protein  45.42 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1521  protein of unknown function DUF81  45.42 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.192995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2333  hypothetical protein  46.84 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0434228  normal  0.030052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1662  hypothetical protein  47.52 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1884  hypothetical protein  46.67 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1219  hypothetical protein  51 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.597323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0490  protein of unknown function DUF81  52.87 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3704  hypothetical protein  52.87 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003380  predicted permease  38.8 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02417  hypothetical protein  39.2 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4140  protein of unknown function DUF81  41.95 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4252  protein of unknown function DUF81  41.95 
 
 		 252 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05313  integral membrane transmembrane protein  42.68 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.487373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3100  hypothetical protein  39.92 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal  0.759008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2660  hypothetical protein  44.08 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2461  hypothetical protein  36.76 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3594  hypothetical protein  38 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.464515  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4209  hypothetical protein  39 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3354  hypothetical protein  37.45 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1272  protein of unknown function DUF81  40.68 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4271  hypothetical protein  48.26 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1706  hypothetical protein  36.76 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105569  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0511  hypothetical protein  34.31 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1845  hypothetical protein  36.73 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.977436  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0096  hypothetical protein  34.58 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1507  hypothetical protein  36.86 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0889  protein of unknown function DUF81  37.86 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2116  hypothetical protein  38.17 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.110414 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4164  hypothetical protein  50.41 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0201322  normal  0.110669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4814  protein of unknown function DUF81  36.91 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1158  hypothetical protein  38.14 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.507411  normal  0.434245 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3876  hypothetical protein  50.86 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1433  protein of unknown function DUF81  37.19 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4962  hypothetical protein  37.28 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1528  protein of unknown function DUF81  37.86 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.116734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2430  hypothetical protein  38.17 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0158  hypothetical protein  30.74 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0534732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  36.86 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0437  protein of unknown function DUF81  44.44 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000268887 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0682  protein of unknown function DUF81  42.56 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0186837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2579  hypothetical protein  35.68 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3457  protein of unknown function DUF81  38 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2925  hypothetical protein  33.84 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3996  hypothetical protein  38.86 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2969  hypothetical protein  33.84 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.669396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0145  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3618  protein of unknown function DUF81  38.8 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.668455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01820  predicted permease  32.82 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2940  hypothetical protein  33.98 
 
 		 255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5342  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164532  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4771  hypothetical protein  38.06 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1521  hypothetical protein  40.28 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3839  hypothetical protein  40.57 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4456  protein of unknown function DUF81  34.12 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1465  hypothetical protein  43.21 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11620  predicted permease  33.86 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6962  protein of unknown function DUF81  33.62 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3920  protein of unknown function DUF81  32.35 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0919  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00030176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2227  hypothetical protein  39.15 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3008  hypothetical protein  33.21 
 
 		 283 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  0.286809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0230  hypothetical protein  33.62 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1700  protein of unknown function DUF81  46.77 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0039  permease  28.22 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0099  protein of unknown function DUF81  38.56 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22070  predicted permease  29.53 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00137949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2178  hypothetical protein  50.21 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4591  protein of unknown function DUF81  33.06 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4130  hypothetical protein  43.05 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2075  protein of unknown function DUF81  37.4 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3067  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3811  protein of unknown function DUF81  31.73 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120426  normal  0.239574 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1085  protein of unknown function DUF81  38.26 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000944956  hitchhiker  0.00000242116 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4266  hypothetical protein  42.6 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3492  hypothetical protein  32.83 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3379  protein of unknown function DUF81  34.02 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000112461  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1771  protein of unknown function DUF81  49.17 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.739642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2125  hypothetical protein  30.28 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.107795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0458  hypothetical protein  32.41 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0208173  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  26.29 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3595  permease-like protein  37.08 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.487773  normal  0.963136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1368  protein of unknown function DUF81  35.19 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.165748  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3069  protein of unknown function DUF81  36.33 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3503  hypothetical protein  36.29 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.408411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  29.13 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2317  protein of unknown function DUF81  32 
 
 		 276 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3272  hypothetical protein  30.83 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0219938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0301  protein of unknown function DUF81  31.42 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0140  putative integral membrane protein  32.3 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2029  hypothetical protein  34.16 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  30.87 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1941  hypothetical protein  44.17 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4317  hypothetical protein  32.46 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1876  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0239532 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1475  protein of unknown function DUF81  35.78 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>