More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3019 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3019  signal-transduction protein  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2035  hypothetical protein  42.47 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2540  signal-transduction protein  54.1 
 
 		 136 aa  113  7.999999999999999e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  28.17 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  24.65 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  24.65 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  26.43 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  29.57 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  26.79 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  29.41 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3746  putative signal transduction protein with CBS domains  38.75 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  24.29 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  36.89 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  34.51 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  34.51 
 
 		 327 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  34.51 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0893  putative signal transduction protein with CBS domains  34.95 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.592016  normal  0.941817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  33.7 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  24.82 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1108  signal-transduction protein  27.08 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1087  signal-transduction protein  29.58 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0884607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.89 
 
 		 380 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1745  hypothetical protein  30.14 
 
 		 144 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.87888 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  34.12 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0896  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.711423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3740  KpsF/GutQ family protein  27.66 
 
 		 391 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47178  predicted protein  25.44 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  29.36 
 
 		 329 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  37.8 
 
 		 907 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  25.86 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  34.88 
 
 		 344 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  34.34 
 
 		 334 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  25.53 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05716  CBS and PB1 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G06780)  36 
 
 		 666 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  28.32 
 
 		 281 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  32.94 
 
 		 331 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1022  cyclic nucleotide-binding protein  35.09 
 
 		 613 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  20.86 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  27.66 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  27.34 
 
 		 427 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  24.6 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1004  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 321 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000464147  hitchhiker  0.000000496759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  24.82 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  23 
 
 		 890 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  34.95 
 
 		 327 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1615  putative CBS domain and cyclic nucleotide- regulated nucleotidyltransferase  39.74 
 
 		 636 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  24.11 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  31.18 
 
 		 155 aa  47.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  28.68 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0782  CBS domain-containing protein  27.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163079  normal  0.38781 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  26.52 
 
 		 491 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  37.76 
 
 		 341 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2993  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 321 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02558  predicted phosphosugar-binding protein  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.937008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0981  KpsF/GutQ family protein  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  32.26 
 
 		 435 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 		 615 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  33.01 
 
 		 327 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2844  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3959  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 615 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4477  signal-transduction protein  25.69 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.458256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  28.45 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2832  D-arabinose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103059 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  27.88 
 
 		 513 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  25.89 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1432 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  32.74 
 
 		 340 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  25.77 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  31 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  36.76 
 
 		 256 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  36.67 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  31.63 
 
 		 502 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 		 689 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  34.44 
 
 		 340 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  34.71 
 
 		 604 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 		 246 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1386  CBS domain-containing protein  25.18 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3616  signal-transduction protein  27.03 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  30.28 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 		 615 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  25.98 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>