More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2844 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02558  predicted phosphosugar-binding protein  99.69 
 
 		 321 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.937008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0981  KpsF/GutQ family protein  99.69 
 
 		 321 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403218  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02523  hypothetical protein  99.69 
 
 		 321 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3959  D-arabinose 5-phosphate isomerase  99.69 
 
 		 321 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2844  D-arabinose 5-phosphate isomerase  100 
 
 		 321 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2993  D-arabinose 5-phosphate isomerase  98.75 
 
 		 321 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2832  D-arabinose 5-phosphate isomerase  99.69 
 
 		 321 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1004  D-arabinose 5-phosphate isomerase  99.07 
 
 		 321 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000464147  hitchhiker  0.000000496759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3024  D-arabinose 5-phosphate isomerase  92.83 
 
 		 321 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000207652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2958  D-arabinose 5-phosphate isomerase  92.83 
 
 		 321 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2989  D-arabinose 5-phosphate isomerase  92.83 
 
 		 321 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.15084  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3147  D-arabinose 5-phosphate isomerase  92.83 
 
 		 321 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00650637  normal  0.0214142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3040  D-arabinose 5-phosphate isomerase  92.52 
 
 		 321 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3180  D-arabinose 5-phosphate isomerase  86.6 
 
 		 321 aa  568  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3575  D-arabinose 5-phosphate isomerase  68.03 
 
 		 323 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.521049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 		 329 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  52.29 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.69 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  49.69 
 
 		 326 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  49.53 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  48.43 
 
 		 324 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.91 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  51.1 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.53 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.43 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.44 
 
 		 339 aa  293  3e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 		 335 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.47 
 
 		 363 aa  292  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  48.58 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 345 aa  291  9e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  48.6 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.42 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.57 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  50.32 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.3 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  47.32 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  46.42 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.66 
 
 		 330 aa  285  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50.48 
 
 		 327 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  46.25 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  47.92 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.89 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  49.15 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  50.49 
 
 		 325 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.89 
 
 		 328 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.81 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  48.91 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  49.15 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  47.6 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.57 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  48.81 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 346 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.33 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 333 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.25 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  45.62 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  47.62 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  46.65 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  43.4 
 
 		 315 aa  277  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  47.2 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  47.62 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  48.12 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  44.97 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  48.64 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.62 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.56 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  49.2 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.56 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>