More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0633 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 553 aa  1104    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  57.36 
 
 		 538 aa  610  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  55.86 
 
 		 549 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  55.68 
 
 		 548 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  54.69 
 
 		 564 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  53.78 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  54.33 
 
 		 552 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  54.13 
 
 		 550 aa  579  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  53.69 
 
 		 561 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  54.35 
 
 		 566 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  52.27 
 
 		 570 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  54.46 
 
 		 572 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  56.57 
 
 		 567 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  55.84 
 
 		 567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  55.84 
 
 		 567 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  55.47 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  55.66 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  53.73 
 
 		 574 aa  559  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  55.11 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.61 
 
 		 559 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  56.78 
 
 		 556 aa  561  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  55.41 
 
 		 552 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  51.4 
 
 		 556 aa  554  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  54.93 
 
 		 567 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  53.61 
 
 		 572 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  53.24 
 
 		 575 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  52.47 
 
 		 568 aa  550  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  54.95 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 575 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  54.3 
 
 		 559 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  51.92 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  51.26 
 
 		 558 aa  545  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  51.71 
 
 		 567 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 557 aa  548  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  54.26 
 
 		 559 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  53.18 
 
 		 565 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  52.81 
 
 		 565 aa  544  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  53.99 
 
 		 581 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  54.44 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  54.26 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  54.08 
 
 		 567 aa  535  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.3 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  50.99 
 
 		 564 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  51.26 
 
 		 567 aa  521  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  53.62 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.67 
 
 		 570 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  51.19 
 
 		 559 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  53.66 
 
 		 558 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  50.91 
 
 		 564 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  52.75 
 
 		 558 aa  505  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  51.13 
 
 		 572 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 580 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  51.99 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  48.57 
 
 		 568 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  49.91 
 
 		 576 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  41.88 
 
 		 552 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  42.23 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  45.37 
 
 		 583 aa  410  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  42.16 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  41.19 
 
 		 543 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  40.56 
 
 		 561 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  41.91 
 
 		 560 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 565 aa  326  8.000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.32 
 
 		 543 aa  309  6.999999999999999e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.91 
 
 		 586 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  39.2 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.39 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.79 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  37.75 
 
 		 587 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.87 
 
 		 567 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 		 552 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.89 
 
 		 552 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  31.75 
 
 		 566 aa  272  9e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.2 
 
 		 556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.88 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.88 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.78 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.88 
 
 		 593 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  30.17 
 
 		 555 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.61 
 
 		 566 aa  266  5e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.96 
 
 		 588 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.04 
 
 		 554 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.74 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.04 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.64 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  32.11 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.85 
 
 		 574 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.04 
 
 		 571 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.83 
 
 		 573 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.74 
 
 		 554 aa  263  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.89 
 
 		 573 aa  263  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30 
 
 		 561 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>