48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1239 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  703    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.335743  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1166  hypothetical protein  95.92 
 
 		 343 aa  660    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.875673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0104  hypothetical protein  42.98 
 
 		 351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.901888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2083  hypothetical protein  30.7 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000452376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0519  hypothetical protein  28.86 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4962  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.936284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2612  hypothetical protein  29.53 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1788  porin  30.46 
 
 		 387 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0218483  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1401  hypothetical protein  28.57 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00461856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1860  porin  29.32 
 
 		 380 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0469133  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0275  porin  27.95 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.450177  hitchhiker  0.0000113069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2365  hypothetical protein  29.22 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000963211  normal  0.0778781 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  31.32 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1745  porin  30.17 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00151108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2535  porin  30.17 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00634878  hitchhiker  0.000395636 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1749  porin  30.17 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0474963  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2437  hypothetical protein  28.95 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1465  hypothetical protein  29.24 
 
 		 383 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00157925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3138  hypothetical protein  28.86 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.363093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2561  porin  27.76 
 
 		 386 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.23329  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0904  hypothetical protein  26.06 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.844767  hitchhiker  0.00000607436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2526  hypothetical protein  28.69 
 
 		 387 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0440119  normal  0.0252757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2728  porin  28.93 
 
 		 379 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0767008  hitchhiker  0.0000304831 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3418  hypothetical protein  28.12 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1263  hypothetical protein  28.25 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  27.78 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00710  hypothetical protein  25.84 
 
 		 387 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03254  secreted protein of porin family  30.64 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  28.57 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  27.14 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  26.06 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4187  hypothetical protein  26.02 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  26.49 
 
 		 477 aa  69.3  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0322  hypothetical protein  27.24 
 
 		 362 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2537  hypothetical protein  23.65 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.125269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  29.15 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  26.52 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0404  hypothetical protein  24.73 
 
 		 475 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.331514  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4728  hypothetical protein  23.68 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.828062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0273  hypothetical protein  24.56 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.74892  hitchhiker  0.000266668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0302  hypothetical protein  23.8 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0852461  normal  0.204946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1411  hypothetical protein  24.08 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  23.5 
 
 		 400 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0287  hypothetical protein  23.12 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000514859  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3321  hypothetical protein  40.58 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  26.43 
 
 		 418 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4828  hypothetical protein  35.71 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3626  hypothetical protein  28.07 
 
 		 593 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0838658  normal  0.628947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>