More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2589 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  100 
 
 		 423 aa  822    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  65.79 
 
 		 488 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  64.92 
 
 		 489 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  66.75 
 
 		 496 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  63.88 
 
 		 507 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  64.44 
 
 		 515 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  63.96 
 
 		 515 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  64.59 
 
 		 485 aa  511  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  57.76 
 
 		 467 aa  428  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  57.76 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  55.8 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  55.56 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  57 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  55.56 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  55.56 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  55.31 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  54 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  55.56 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  55.56 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  55.31 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  55.31 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  55.5 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  53.96 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  57.25 
 
 		 397 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  52.12 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  55.22 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  53.48 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  54.32 
 
 		 431 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  55.72 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  55.94 
 
 		 405 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  53.64 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  51.89 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  53.64 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  53.68 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  54.34 
 
 		 408 aa  388  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  53.68 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  53.68 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  53.68 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  54.48 
 
 		 445 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  53.71 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  51.27 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  53.68 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  53.18 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  52.7 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0566  ammonium transporter  49.53 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0404362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  52.24 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  53.68 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  53.68 
 
 		 500 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  54.14 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  53.43 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  54.8 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  52.59 
 
 		 432 aa  385  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  54.09 
 
 		 408 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  50.96 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  53.37 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0086  ammonium transporter  51.42 
 
 		 444 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  53.19 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  53.19 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  53.19 
 
 		 504 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  53.35 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  53.96 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  53.19 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  53.19 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0094  ammonium transporter  51.02 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.162623  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  54.52 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  50.23 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  52.61 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  50.72 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  52.5 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  50.37 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  52.38 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  50.72 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0089  ammonium transporter  49.08 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1999  ammonium transporter  52.29 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  50.71 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  51.63 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2672  ammonium transporter  52.43 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000545054  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  49.31 
 
 		 437 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  53.73 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  53.58 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  51.25 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  50.94 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  53.5 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3855  ammonium transporter  50.84 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0800844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  51.72 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.96 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  49.31 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  49.76 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  49.31 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  53.63 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  49.08 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  54.35 
 
 		 433 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  49.76 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  53.5 
 
 		 444 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1298  ammonium transporter  49.76 
 
 		 456 aa  363  4e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  53.79 
 
 		 503 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  53.79 
 
 		 497 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  50.63 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  50.23 
 
 		 449 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  46.58 
 
 		 494 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>