92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1514 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 401 aa  822    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  62.31 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  62.91 
 
 		 399 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  61.75 
 
 		 399 aa  522  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  61.75 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  62.16 
 
 		 399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  62.16 
 
 		 399 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  60.15 
 
 		 398 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.37 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  50.25 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  51.86 
 
 		 403 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  54.59 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.48 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  53 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  49.5 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  48.64 
 
 		 404 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  50 
 
 		 407 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  51.7 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  52.92 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  52.63 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  47.76 
 
 		 383 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  50.14 
 
 		 383 aa  346  4e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.03 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 		 387 aa  335  7e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  44.96 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 		 393 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44.17 
 
 		 396 aa  319  6e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  47.11 
 
 		 398 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.29 
 
 		 414 aa  222  8e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.63 
 
 		 409 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 413 aa  209  9e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.85 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.97 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.85 
 
 		 429 aa  189  7e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 411 aa  188  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.41 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.48 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 392 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  26.76 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.47 
 
 		 421 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 401 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.03 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.99 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.12 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  26.84 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 409 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  24.66 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.06 
 
 		 426 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 401 aa  116  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.79 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.06 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.99 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.29 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.25 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  25.41 
 
 		 428 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.78 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  24.55 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  22.22 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  26.24 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  36.27 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  30.77 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  22.99 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  36.49 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  33.33 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  26.36 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  25.36 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  34.62 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  31.82 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  31.82 
 
 		 306 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  29.36 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  23.68 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  24.86 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  26.22 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>