234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1374 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  100 
 
 		 421 aa  865    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  70.87 
 
 		 418 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  66.83 
 
 		 421 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  66.1 
 
 		 421 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  28.22 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  29.05 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  30.28 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  28.44 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.38 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  27.56 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  29.06 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  24.46 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  23.42 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  25.14 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  27.18 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.21 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.72 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  30.43 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  27.12 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.76 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.14 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  38.32 
 
 		 776 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.14 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.83 
 
 		 469 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  27.53 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.58 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  24.23 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.65 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.94 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  28.18 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.39 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  27.36 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  25.14 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.38 
 
 		 413 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.15 
 
 		 413 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  27.99 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  25.09 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  25.89 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  27.84 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  26.53 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  25 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.16 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.57 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.57 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.57 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  22.22 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.41 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  25.55 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  30.47 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  23.72 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  25.9 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25.61 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.52 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  27.57 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  21.74 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  21.82 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  25.58 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  26.28 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  25 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  25.36 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.71 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  23.44 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  23.44 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  22.71 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  25.72 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  25.17 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.68 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  21.52 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  21.05 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  25.59 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  22.09 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  27.84 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.55 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  26.13 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  24.68 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  37.35 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  27.14 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.36 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  27.07 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  24.68 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  26.42 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  26.42 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>