58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0782 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0782  putative helix-turn-helix transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  330  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  22.86 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  32.35 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  37.29 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  55.26 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0879  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.544594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0861  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1001  transcriptional regulator, MarR family  23.86 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0958  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 334 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0900  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.78 
 
 		 283 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1045  MarR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.734934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  27.78 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1596  MarR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1040  transcriptional regulator, MarR family  23.86 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69196e-21 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2028  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.400753  hitchhiker  0.000427569 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1128  transcriptional regulator, MarR family  23.86 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  22.68 
 
 		 146 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  24.1 
 
 		 142 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3411  transcriptional regulator, MarR family  24.03 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000113598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 303 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  28.1 
 
 		 381 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  21.77 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  44.44 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0403  MarR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  21.98 
 
 		 189 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1755  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>