More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1957 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1957  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1787  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.02 
 
 
182 aa  329  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.495229 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1001  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  91.46 
 
 
196 aa  297  5e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.846644  normal  0.110077 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0336  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  94.61 
 
 
183 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210833  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.61 
 
 
374 aa  213  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0330  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.24 
 
 
147 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2046  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.29 
 
 
145 aa  186  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609806 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2273  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.45 
 
 
144 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.732152  normal  0.19632 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1791  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.23 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.102386  normal  0.996186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1079  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  55.41 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.231254  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2012  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50.34 
 
 
170 aa  173  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1723  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.33 
 
 
170 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0277  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  52.05 
 
 
174 aa  165  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000680057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2472  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  48.65 
 
 
176 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11251  hypothetical protein  47.52 
 
 
211 aa  147  7e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  48.92 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0364  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 
180 aa  145  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3411  F420H2 dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
184 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.16959  normal 
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  45.77 
 
 
166 aa  144  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0539  NADH dehydrogenase subunit B  45.73 
 
 
271 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573079  normal  0.187495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1023  NADH dehydrogenase subunit B  46.45 
 
 
190 aa  144  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0510  NADH:ubiquinone oxidoreductase  47.48 
 
 
184 aa  143  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1170  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
177 aa  142  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3329  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
191 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.167  normal  0.106059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  50 
 
 
170 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  51.09 
 
 
170 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0742  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
174 aa  142  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.848967  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  46.3 
 
 
264 aa  141  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3629  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.06 
 
 
176 aa  141  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.689489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1308  NADH dehydrogenase subunit B  46.71 
 
 
177 aa  141  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.383301  normal  0.0794973 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1175  NADH dehydrogenase subunit B  46.41 
 
 
176 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2513  NADH dehydrogenase subunit B  46.41 
 
 
174 aa  140  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1123  NADH dehydrogenase subunit B  46.67 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0922  NADH dehydrogenase subunit B  47.1 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.68 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2423  NADH dehydrogenase subunit B  46.9 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  42.68 
 
 
170 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.59 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6681  NADH dehydrogenase subunit B  48.23 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  47.48 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0664  NADH dehydrogenase (quinone)  45.33 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  45.39 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  49.64 
 
 
179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  49.64 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0316  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  47.06 
 
 
170 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.338245 
 
 
-
 
NC_004310  BR0803  NADH dehydrogenase subunit B  46.21 
 
 
193 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3169  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.89 
 
 
184 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  48.91 
 
 
170 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  47.83 
 
 
167 aa  139  3e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0798  NADH dehydrogenase subunit B  46.21 
 
 
193 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.802177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0390  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.06 
 
 
188 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1181  NADH dehydrogenase subunit B  45.33 
 
 
235 aa  138  4.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468276  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0461  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.06 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  44.93 
 
 
250 aa  138  6e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2006  NADH dehydrogenase subunit B  46.85 
 
 
174 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  45.59 
 
 
207 aa  137  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  46.32 
 
 
228 aa  137  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1664  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  50 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2983  NADH dehydrogenase subunit B  46.21 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4127  NADH dehydrogenase subunit B  46.26 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2302  NADH dehydrogenase subunit B  47.41 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3225  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.79 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.11443  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1859  NADH dehydrogenase subunit B  47.79 
 
 
245 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4391  NADH dehydrogenase subunit B  46.26 
 
 
195 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0686971  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
160 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03170  NADH dehydrogenase subunit B  47.14 
 
 
182 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1241  NADH-quinone oxidoreductase subunit B  47.79 
 
 
244 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  41.34 
 
 
251 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  44.37 
 
 
160 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  47.41 
 
 
158 aa  136  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5969  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  47.37 
 
 
188 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3754  NADH dehydrogenase subunit B  44.6 
 
 
247 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  46.36 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  44.08 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25251  NADH dehydrogenase subunit B  46.72 
 
 
250 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1296  F420H2 dehydrogenase subunit B  43.71 
 
 
184 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3080  NADH dehydrogenase subunit B  47.45 
 
 
179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0688011  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  47.52 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1310  NADH dehydrogenase subunit B  47.41 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686478  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  46.36 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1018  NADH dehydrogenase subunit B  45.58 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  45.83 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2059  NADH dehydrogenase subunit B  45.58 
 
 
195 aa  135  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.769624  normal  0.464052 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1659  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
249 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.094146  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03731  NADH dehydrogenase subunit B  46.04 
 
 
249 aa  135  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.23212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1213  NADH dehydrogenase subunit B  45.58 
 
 
195 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4482  NADH dehydrogenase subunit B  50.38 
 
 
184 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00198426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1084  NADH dehydrogenase subunit B  45.58 
 
 
195 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0355895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4557  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  46.81 
 
 
226 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.770439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2573  NADH dehydrogenase subunit B  46.38 
 
 
204 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.196668  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  48.55 
 
 
172 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>